Basic Information

Symbol
HSD17B6
RNA class
mRNA
Alias
Hydroxysteroid 17-Beta Dehydrogenase 6 SDR9C6 RODH HSE Short Chain Dehydrogenase/Reductase Family 9C Member 6 Oxidative 3-Alpha-Hydroxysteroid-Dehydrogenase 17-Beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase Type 6 3(Alpha->Beta)-Hydroxysteroid Epimerasel 3-Hydroxysteroid Epimerase Retinol Dehydrogenase 3-Alpha->Beta-HSE Oxidoreductase 17-Beta-HSD 6 EC 1.1.1.105 NAD+ -Dependent 3 Alpha-Hydroxysteroid Dehydrogenase 3-Hydroxysteroid Epimerase Hydroxysteroid (17-Beta) Dehydrogenase 6 Homolog (Mouse) Short Chain Dehydrogenase/Reductase Family 9C, Member 6 NAD+ -Dependent 3 Alpha-Hydroxysteroid Dehydrogenase Hydroxysteroid (17-Beta) Dehydrogenase 6 Homolog Oxidative 3-Alpha Hydroxysteroid Dehydrogenase Hydroxysteroid (17-Beta) Dehydrogenase 6 3(Alpha->Beta)-Hydroxysteroid Epimerase 3-Alpha->Beta-Hydroxysteroid Epimerase 17-Beta-HSD6 EC 1.1.1.209 EC 1.1.1.239 EC 1.1.1.53 EC 1.1.1.62 EC 1.1.1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_003725.4
Sequence length
1512.0 nt
GC content
0.4484

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-471.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -497.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 436.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(.((((((.((........)).)))))).).)))).....((((((...........))))))((((((((...)))..)))))((((((((((....((((((((.((.((((.(((((.(((((....))))).....((((.........))))))))))))).)).)))))))).(((.....(((((((((.(((((.((((.((((((...((((((((((((.(.((.((((......)))).)).).).)))))))))))..((((((((.(.(.(((.....)))).).)))).))))(((..(((((......((((((..((((((((((.(((((((((((..((((((((((.....))))....((((((((((..((((((.(((((.(.((.....)).).).))))......(((((((.((((....)))).)).))))).))))))....)))))))))).....(((((...((.(((......))).))....)))))))))))..)))))))...(((((....(((((((((....))))).))))))))).......)))).))))))))))(((((....)))))((((((.(((((..((((..(((((((((((.....(((((((...(((...(((((...))))))))((.((.((((((((.((((........)))).)).)))))).)).))))))))).....)))...........))))))))))))...))))).))))))..)))))).....)))))..))).......(((((..((((((((..((((((((((((.((((((........))))))..(((((((((((((((((((...(((.......)))...)).))))).(((...(((.(((....))).)))))).((....))..)))))))(((..((((((.............)))))).)))..................((((((((......)))).)))).....)))))..((((((((((....((....))...))))))))))(((.....((((((((((((.((......(((((((......(((.((.((((..........)))).)).)))))))))).....)).))))))....))))))....)))..))))))))))))....))))))))..)).....))).....(((((......)))))................)))))).....))))))))))))))))))...)))...((((((((((.............))))))))))...(((((((...(.((((((((((......))))).))))).)...)))))))...((((.((((((((((((((((((((((((((((........)))))).)))..)))))))....)))))))...))))).))))....................))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.{.((((((.((........)).)))))).}.)))).....((((((...........))))))((((({{,...,})..)))))((((((((({....((((((((.((.((((.(((((.(((((....))))).....((((.........))))))))))))).)).)))))))).{{{.....(((((((((.((((({((((.((((((.,.((((((((((((.(.((.((((......)))).)).).).)))))))))))..{{(({{((.(,(.{{{.,,,.)),,,),||||{||||(((,,(((((,,..,,((({{{..(((({((|{{,{|{|||(((((,.{((({,((((..,,,|}}}..{,((({{{{((({{((((({{{({({.{,(({{(,.||.,,,.||||{{{,,|(((((,,.,(((...,||||{||.|||||.|}}}},....})||||}}}}..}}}|((((.{.({.(((......))).)).,..))))}})))))..}}}}))),.|||{((|.,|{,(((((((..,{|,}},.}}))}})))}}}..,.,))),,)))}))}}},{(((,,,.||}||((((((,(((((,,((((,.{(({{{{((((...|.|||||{||.,||||}}|||||..,|||||||,((.((.((((((,,.{(({,.,.....)))}.},.)))))).)).)),,)))))}}}..)))|||.,...}}})})))))))))),,,)}}}}.}}}}}}..)))})}.....}))))},,})......,{(,,,}||{{{,,{{{,(({{{{(((({({(((((,,.......)),,,)}}||||{||||||.{{{{{{{...{||,...,,.}}},,,)),))))).,|}..}|||}||{.,}}}))}})})))}{{....)}...,))))}}}|,.((((((...,....,,.,.)))))).,,,..................((((((((......)))).))))..}}})))))..((((((((((....((....))...))))))))))((({,.,.{,,,||||||,...({({(((((((((({((.{{(,{..{,((,({{...{{{...|{{{.....,.{{{|...,)}).....))))...})).}..}}}.)),,,.}}},)))))))}})},,,,,,,)))))}))).,,,|,,||(((((......))))}.,......,.....,.)))))).....))))))))))))))))))...}}}{((((,,((((..,{,,.{{,,,.,,||{|||,{{(({..((((((...,.((((((((((......))))).))))).}...)))))))))}}|||.{{{{{(((((((((((((((((((((((.,....,.)))))).)))..)))))))....))))))).,,)}}}).))))....,}},,))}}..))))}})))))))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGCAGUUGGGGCAGGAGGAAGCCGACUGCUGCCUGGUCUGCAAAGAAGU… 1512 nt 0.4484
Summary

The protein encoded by this gene has both oxidoreductase and epimerase activities and is involved in androgen catabolism. The oxidoreductase activity can convert 3 alpha-adiol to dihydrotestosterone, while the epimerase activity can convert androsterone to epi-androsterone. Both reactions use NAD+ as the preferred cofactor. This gene is a member of the retinol dehydrogenase family. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

A study in Apoe-/- mice demonstrated that cigarette smoke exposure induced dysregulation of lipid and bile acid metabolism, with the HSD17B6 being downregulated in the liver, an effect that was reduced upon switching to a candidate modified risk tobacco product or cessation [Lo Sasso et al. DOI: 10.3109/08958378.2016.1150368].