Basic Information

Symbol
HSP90AB1
RNA class
mRNA
Alias
Heat Shock Protein 90 Alpha Family Class B Member 1 HSPC2 HSPCB Heat Shock Protein 90kDa Alpha (Cytosolic), Class B Member 1 Heat Shock Protein Family C Member 3 Heat Shock 90kD Protein 1, Beta Heat Shock Protein HSP 90-Beta Heat Shock 84 KDa HSP90B HSP84 Heat Shock Protein 90kDa Alpha Family Class B Member 1 Heat Shock 90kDa Protein 1, Beta Heat Shock Protein 90 KDa HSP90-Beta D6S182 HSP 90 HSP 84 HSPC3
Location (GRCh38)
6:44245808-44253888
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007355.4
Sequence length
2555.0 nt
GC content
0.4720

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-762.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -809.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 907.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001271969.2 NCBI
CUCUCGAGUCACUCCGGCGCAGUGUUGGGACUGUCUGGGUAUCGGAAAG… 2568 nt 0.4700
NM_001271970.2 NCBI
ACUCUCAGUCUGCAAAAGUGUACGCCCGCAGAGCCGCCCCAGGUGCCUG… 2611 nt 0.4810
NM_001271971.2 NCBI
CUCUCGAGUCACUCCGGCGCAGUGUUGGGACUGUCUGGGUAUCGGAAAG… 2411 nt 0.4716
NM_001271972.2 NCBI
CUCUCGAGUCACUCCGGCGCAGUGUUGGGACUGUCUGGGUAUCGGAAAG… 2525 nt 0.4709
NM_001371238.1 NCBI
AGUGACGAGUGUCGGCCUGGUGGCUACGGCCACCAUCUUUCUUGGGUUU… 2597 nt 0.4729
NM_007355.4 NCBI
CUCUCGAGUCACUCCGGCGCAGUGUUGGGACUGUCUGGGUAUCGGAAAG… 2555 nt 0.4720
Summary

This gene encodes a member of the heat shock protein 90 family; these proteins are involved in signal transduction, protein folding and degradation and morphological evolution. This gene encodes the constitutive form of the cytosolic 90 kDa heat-shock protein and is thought to play a role in gastric apoptosis and inflammation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Pseudogenes have been identified on multiple chromosomes. [provided by RefSeq, Dec 2012]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the HSP90AB1 was down-regulated in whisker follicles following methamphetamine self-administration and further after withdrawal, identifying it as a potential regulator of drug reward and addiction through network topology analysis [Song et al. DOI:10.1038/s41598-018-29772-1]. In mice, single-nucleus transcriptomics of the ventral tegmental area showed the HSP90AB1 was up-regulated in shared neuronal populations during the addicting phase of nicotine self-administration but down-regulated in the post-addiction phase, indicating a dynamic, phase-specific role in mitochondrial energy metabolism associated with addiction progression [Fan et al. DOI:10.1016/J.Jgg.2024.08.009].