Basic Information
Symbol
HSPA1L
RNA class
mRNA
Alias
Heat Shock Protein Family A (Hsp70) Member 1 Like
HSP70-HOM
Hum70t
Heat Shock Protein Family A Member 1L
Heat Shock 70 KDa Protein 1-Like
Heat Shock 70kDa Protein 1-Like
Heat Shock 70 KDa Protein 1-Hom
Heat Shock 70kD Protein-Like 1
Heat Shock 70 KDa Protein 1L
Epididymis Secretory Sperm Binding Protein
Heat Shock 10kDa Protein 1-Like
HSP70-Hom
HSP70-1L
HSP70T
Location (GRCh38)
6:31809619-31815788
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
Time since deposition estimation
MANE select
Transcript ID
NM_005527.4
Sequence length
2762.0 nt
GC content
0.5076
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-956.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1004.64 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
666.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUUGGUCUCCAUGGCGAUGCUGACCGCCUGCGCUUCAGCGCCUAAUUGA… | 2762 nt | 0.5076 |
Summary
This gene encodes a 70kDa heat shock protein. In conjunction with other heat shock proteins, this protein stabilizes existing proteins against aggregation and mediates the folding of newly translated proteins in the cytosol and in organelles. The gene is located in the major histocompatibility complex class III region, in a cluster with two closely related genes which also encode isoforms of the 70kDa heat shock protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in weanling swine demonstrated that cutaneous bromine vapor exposure significantly increased the HSPA1L transcript at all post-exposure time points (6h, 48h, 7 days) for both 7- and 17-minute exposures, with fold changes ranging from 2.097 to 2.556 [Price et al. DOI:10.3109/15569527.2010.546003]. In humans, a genetic association study identified a 5-bp indel polymorphism (rs3036297) in the related HSPA1B gene as significantly associated with susceptibility to sudden cardiac death, where the insertion allele conferred a lower risk (OR=0.58), and functional assays showed this variant regulates gene expression via miR-134-5p binding and long-range interactions with HLA-DRB5 [Yang et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2020.110637]. A study in humans demonstrated that the HSPA1L exhibits statistically significant rhythmic expression in blood, with peak expression in the afternoon (15:30-17:00 h), and was identified as one of three final mRNA predictors for estimating blood deposition time [Lech et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2015.12.008].