Basic Information

Symbol
HSPA4
RNA class
mRNA
Alias
Heat Shock Protein Family A (Hsp70) Member 4 HSPH2 HS24/P52 Heat Shock Protein Family H Member 2 Heat Shock 70-Related Protein APG-2 Heat Shock 70 KDa Protein 4 Heat Shock 70kD Protein 4 Hsp70 RY Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Li 5a Heat Shock Protein, 110 KDa Heat Shock 70kDa Protein 4 HEL-S-5a Hsp70RY HSP70RY APG-2 Hsp70 APG2 RY
Location (GRCh38)
5:133051946-133106449
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002154.4
Sequence length
4774.0 nt
GC content
0.4238

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1378.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1470.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1540.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002154.4 NCBI
GAGAUCUUCUCCGCCCCCGCUACCGGCGCCUCCUCUGCGGCCACUGAGC… 4774 nt 0.4238
Summary

Predicted to enable adenyl-nucleotide exchange factor activity. Involved in chaperone-mediated protein complex assembly and protein insertion into mitochondrial outer membrane. Located in cytosol and extracellular exosome. Implicated in Chagas disease. Biomarker of chronic obstructive pulmonary disease; rheumatoid arthritis; type 2 diabetes mellitus; and ulcerative colitis. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the expression of the HSPA4 mRNA in the hypothalamus and frontal cortex showed no significant change in a fatal hypothermia group compared to a control group [Umehara et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2011.01.005].