Basic Information

Symbol
HSPA4L
RNA class
mRNA
Alias
Heat Shock Protein Family A (Hsp70) Member 4 Like HSPH3 APG-1 Osp94 Heat-Shock Protein Family A Member 4-Like Protein Heat Shock Protein Family H Member 3 Heat Shock 70-Related Protein APG-1 Heat Shock 70kDa Protein 4-Like Heat Shock 70 KDa Protein 4L Osmotic Stress Protein 94 HSPA4-Like Protein APG1 Testis Tissue Sperm-Binding Protein Li 64n Heat Shock 70 KDa Protein 4-Like Protein Heat Shock Protein (Hsp110 Family) OSP94
Location (GRCh38)
4:127781821-127840733
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014278.4
Sequence length
10608.0 nt
GC content
0.3747

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3119.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3326.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2647.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001317381.2 NCBI
ACAAGGGGAGGGCGCCGGGCUGCACAUGGGCCCCUCGGGGAGGCGAGGC… 10736 nt 0.3795
NM_001317382.2 NCBI
AUGUUCCGUUGUUUCUCUGGCCUGGGAAGUUUGUUGGCAAGGAAUAUAA… 10430 nt 0.3669
NM_001317383.2 NCBI
AGUAGGGAAAGACCCAGGCUGCGGGACGCGGUGCAGGCUGCGGCGCUGA… 10485 nt 0.3742
NM_014278.4 NCBI
AGUAGGGAAAGACCCAGGCUGCGGGACGCGGUGCAGGCUGCGGCGCUGA… 10608 nt 0.3747
Summary

The protein encoded by this gene is heat shock inducible and may act as a chaperone. The encoded protein can protect the heat-shocked cell against the harmful effects of aggregated proteins. This gene is highly expressed in leukemia cells and may be a good target for therapeutic intervention. Several transcripts encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the HSPA4L gene was downregulated as part of the inhibited protein folding pathway in the lungs and brain of sepsis patients compared to uninfected controls [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].