Basic Information

Symbol
HSPA6
RNA class
mRNA
Alias
Heat Shock Protein Family A (Hsp70) Member 6 HSP70B' Heat Shock 70kDa Protein 6 (HSP70B') Heat Shock Protein Family A Member 6 Heat Shock 70kD Protein 6 (HSP70B') Heat Shock 70 KDa Protein B' Heat Shock 70 KDa Protein 6 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein
Location (GRCh38)
1:161524540-161526894
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002155.5
Sequence length
2355.0 nt
GC content
0.5864

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-958.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -995.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 439.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002155.5 NCBI
AGAUCCGAGCCGGGCUGGCUGCAGAGAAACCGCAGGGAGAGCCUCACUG… 2355 nt 0.5864
Summary

Enables several functions, including ATP hydrolysis activity; heat shock protein binding activity; and unfolded protein binding activity. Involved in cellular response to heat and protein refolding. Located in COP9 signalosome; centriole; and cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human HT-29 colorectal adenocarcinoma cells demonstrated that the HSPA6 was the most highly induced gene (1035.59-fold) following arsenic trioxide exposure according to microarray analysis [Kazuta et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2026.102774]. In human skin, analysis of temporal gene expression after thermal injury found the HSPA6 to be significantly up-regulated in burned tissue compared to normal skin [Greco et al. DOI:10.1016/j.burns.2009.06.211].