Basic Information

Symbol
HSPH1
RNA class
mRNA
Alias
Heat Shock Protein Family H (Hsp110) Member 1 KIAA0201 NY-CO-25 HSP105B HSP105A Heat Shock Protein Family H Member 1 Heat Shock 105kDa/110kDa Protein 1 Heat Shock Protein 105 KDa Antigen NY-CO-25 HSP105 Heat Shock 110 KDa Protein HSP110
Location (GRCh38)
13:31134876-31162388
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006644.4
Sequence length
5244.0 nt
GC content
0.3959

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1411.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1514.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1491.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286503.2 NCBI
GGGUCGGUAGUUCAGCGCCGGCGCCGGUGUGCGAGCCGCGGCAGAGUGA… 5112 nt 0.3944
NM_001286504.1 NCBI
ACACUUCUCCCAGCGGGACUACGAUUCCCAACAUGCUCUCCGGACAGCU… 5221 nt 0.3873
NM_001286505.1 NCBI
ACACUUCUCCCAGCGGGACUACGAUUCCCAACAUGCUCUCCGGACAGCU… 4987 nt 0.3858
NM_001349704.2 NCBI
GGGUCGGUAGUUCAGCGCCGGCGCCGGUGUGCGAGCCGCGGCAGAGUGA… 4994 nt 0.4019
NM_006644.4 NCBI
GGGUCGGUAGUUCAGCGCCGGCGCCGGUGUGCGAGCCGCGGCAGAGUGA… 5244 nt 0.3959
Summary

This gene encodes a member of the heat shock protein 70 family of proteins. The encoded protein functions as a nucleotide exchange factor for the molecular chaperone heat shock cognate 71 kDa protein (Hsc70). In addition, this protein plays a distinct but related role as a holdase that inhibits the aggregation of misfolded proteins, including the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) protein. Elevated expression of this protein has been observed in numerous human cancers. [provided by RefSeq, Mar 2017] CIViC Summary for HSPH1 Gene

Forensic Context

A study in human neonates demonstrated that the HSPH1 was upregulated at birth in those who later developed early-onset sepsis and was a key component of a validated 4-gene predictive signature with a training AUC of 0.94 [An et al. DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105411]. In a separate study of adult burn patients, the HSPH1 was also found to be upregulated at hospital admission and was associated with early mortality following injury [Burook Misganaw et al. DOI:10.1093/jbcr/iraf012].