Basic Information

Symbol
HTR1F
RNA class
mRNA
Alias
5-Hydroxytryptamine Receptor 1F HTR1EL 5-HT1F 5-Hydroxytryptamine (Serotonin) Receptor 1F, G Protein-Coupled Serotonin Receptor 1F 5-HT-1F 5-Hydroxytryptamine (Serotonin) Receptor 1F 5HT6 MR77
Location (GRCh38)
3:87792704-87993839
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001322209.2
Sequence length
3386.0 nt
GC content
0.3574

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-807.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -875.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 820.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000866.5 NCBI
GAGACCAGACAGGAUCUCUUCAAGAGCAGAGUCAAGAGCCUGGAGGGCG… 3248 nt 0.3439
NM_001322208.2 NCBI
GCAGUCAGCGUCGCGGCCCCGAAAGCUGGCGACAGGCGCUGCUGUCUUC… 3876 nt 0.3947
NM_001322209.2 NCBI
GCAGUCAGCGUCGCGGCCCCGAAAGCUGGCGACAGGCGCUGCUGUCUUC… 3386 nt 0.3574
NM_001322210.2 NCBI
GCAGUCAGCGUCGCGGCCCCGAAAGCUGGCGACAGGCGCUGCUGUCUUC… 3447 nt 0.3641
Summary

Enables Gi/o-coupled serotonin receptor activity; serotonin binding activity; and serotonin receptor activity. Involved in adenylate cyclase-inhibiting serotonin receptor signaling pathway. Located in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that prenatal psychostimulant exposure permanently impairs glucose homeostasis in adult female offspring by disrupting serotonin signaling in pancreatic beta cells, with the HTR1F being expressed in both human and mouse beta cells [Korchynska et al. DOI:10.15252/embj.2018100882].