Basic Information

Symbol
HTR2B
RNA class
mRNA
Alias
5-Hydroxytryptamine Receptor 2B 5-HT2B 5-HT(2B) 5-Hydroxytryptamine (Serotonin) Receptor 2B, G Protein-Coupled Serotonin Receptor 2B 5-HT-2B 5-Hydroxytryptamine (Serotonin) Receptor 2B 5-Hydroxytryptamine 2B Receptor 5-HT 2B Receptor
Location (GRCh38)
2:231108230-231125080
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000867.5
Sequence length
2170.0 nt
GC content
0.3949

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-531.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -572.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 544.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000867.5 NCBI
AGUCACAGCAGCAAGCAAGUCUAGUGAACAGAUAAGAUGACAUGCUCAG… 2170 nt 0.3949
NM_001320758.2 NCBI
AGUCACAGCAGCAAGCAAGUCUAGUGAACAGAUAAGAUGACAUGCUCAG… 1787 nt 0.4007
Summary

This gene encodes one of the several different receptors for 5-hydroxytryptamine (serotonin) that belongs to the G-protein coupled receptor 1 family. Serotonin is a biogenic hormone that functions as a neurotransmitter, a hormone, and a mitogen. Serotonin receptors mediate many of the central and peripheral physiologic functions of serotonin, including regulation of cardiovascular functions and impulsive behavior. Population and family-based analyses of a minor allele (glutamine-to-stop substitution, designated Q20*) which blocks expression of this protein, and knockout studies in mice, suggest a role for this gene in impulsivity. However, other factors, such as elevated testosterone levels, may also be involved. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that prenatal exposure to psychostimulants like amphetamine permanently impairs glucose homeostasis in adult female offspring by reducing insulin production in pancreatic beta cells, linking this effect to disrupted serotonin signaling and sex-specific epigenetic reprogramming of serotonin-related gene networks [Korchynska et al. DOI:10.15252/embj.2018100882].