Basic Information

Symbol
HTRA1
RNA class
mRNA
Alias
HtrA Serine Peptidase 1 IGFBP5-Protease PRSS11 ARMD7 HtrA High-Temperature Requirement A Serine Peptidase 1 Protease, Serine, 11 (IGF Binding) Serine Protease HTRA1 L56 Serine Protease 11 EC 3.4.21.108 EC 3.4.21.- EC 3.4.21 CADASIL2 CARASIL2 CARASIL ORF480 HTRA
Location (GRCh38)
10:122458551-122514907
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002775.5
Sequence length
2091.0 nt
GC content
0.5806

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-812.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -851.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 527.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002775.5 NCBI
ACUCGCACCCGCUGCCCCCGAGGCCCUCCUGCACUCUCCCCGGCGCCGC… 2091 nt 0.5806
Summary

This gene encodes a member of the trypsin family of serine proteases. This protein is a secreted enzyme that is proposed to regulate the availability of insulin-like growth factors (IGFs) by cleaving IGF-binding proteins. It has also been suggested to be a regulator of cell growth. Variations in the promoter region of this gene are the cause of susceptibility to age-related macular degeneration type 7. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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