Basic Information

Symbol
HTRA2
RNA class
mRNA
Alias
HtrA Serine Peptidase 2 OMI PARK13 PRSS25 High Temperature Requirement Protein A2 Serine Protease HTRA2, Mitochondrial Omi Stress-Regulated Endoprotease Serine Proteinase OMI Protease, Serine, 25 Serine Protease 25 EC 3.4.21.108 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein HtrA-Like Serine Protease MGCA8 HtrA2
Location (GRCh38)
2:74529596-74533350
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_013247.5
Sequence length
1785.0 nt
GC content
0.5793

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-748.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -778.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 348.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001321727.1 NCBI
CGUGGAUCCCGAGAAAGAGGCGCAGGACGAGGAGGCAGAACCCGACUGG… 2484 nt 0.6019
NM_001321728.1 NCBI
CGUGGAUCCCGAGAAAGAGGCGCAGGACGAGGAGGCAGAACCCGACUGG… 2454 nt 0.6015
NM_013247.5 NCBI
CUACUGUCCGCCUGCUCGCGUCCUGGGUGCCGCCUCUGAGUAGGGCGGG… 1785 nt 0.5793
NM_145074.2 NCBI
CGUGGAUCCCGAGAAAGAGGCGCAGGACGAGGAGGCAGAACCCGACUGG… 2259 nt 0.6060
Summary

This gene encodes a serine protease. The protein has been localized in the endoplasmic reticulum and interacts with an alternatively spliced form of mitogen-activated protein kinase 14. The protein has also been localized to the mitochondria with release to the cytosol following apoptotic stimulus. The protein is thought to induce apoptosis by binding the apoptosis inhibitory protein baculoviral IAP repeat-containing 4. Nuclear localization of this protein has also been observed. Alternate splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the expression of the HTRA2 gene, associated with the mitochondrial unfolded protein response, was significantly down-regulated in the subcutaneous adipose tissue of heavier co-twins within body mass index-discordant monozygotic twin pairs, indicating a relationship between reduced expression of this pathway and acquired obesity [Jukarainen et al. DOI:10.1210/jc.2015-3095].