Basic Information

Symbol
HUS1
RNA class
mRNA
Alias
HUS1 Checkpoint Clamp Component Checkpoint Protein HUS1 Hus1+-Like Protein HHUS1 HUS1 (S. Pombe) Checkpoint Homolog HUS1 Checkpoint Homolog (S. Pombe) HUS1 Checkpoint Homolog
Location (GRCh38)
7:47961882-47979682
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004507.4
Sequence length
3007.0 nt
GC content
0.4383

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-867.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -923.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 697.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363683.2 NCBI
ACUGUUCGCGCUGCCGUGUUUCCGGGCGGGGACACUCAGGGCGCGACGC… 3065 nt 0.4431
NM_004507.4 NCBI
ACUGUUCGCGCUGCCGUGUUUCCGGGCGGGGACACUCAGGGCGCGACGC… 3007 nt 0.4383
Summary

The protein encoded by this gene is a component of an evolutionarily conserved, genotoxin-activated checkpoint complex that is involved in the cell cycle arrest in response to DNA damage. This protein forms a heterotrimeric complex with checkpoint proteins RAD9 and RAD1. In response to DNA damage, the trimeric complex interacts with another protein complex consisting of checkpoint protein RAD17 and four small subunits of the replication factor C (RFC), which loads the combined complex onto the chromatin. The DNA damage induced chromatin binding has been shown to depend on the activation of the checkpoint kinase ATM, and is thought to be an early checkpoint signaling event. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.