Basic Information

Symbol
HVCN1
RNA class
mRNA
Alias
Hydrogen Voltage Gated Channel 1 VSOP Voltage Sensor Domain-Only Protein Hv1 Hydrogen Voltage-Gated Channel 1 Voltage-Gated Hydrogen Channel 1 MGC15619 HV1
Location (GRCh38)
12:110627841-110704950
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032369.4
Sequence length
1685.0 nt
GC content
0.5056

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-541.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -571.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 556.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001040107.2 NCBI
GUACGAGUUGGCCCGGAGCAAGGCGGCCCAGGACAGGCAGGGGCUGCAC… 1701 nt 0.5056
NM_001256413.2 NCBI
GUACGAGUUGGCCCGGAGCAAGGCGGCCCAGGACAGGCAGGGGCUGCAC… 1661 nt 0.5039
NM_032369.4 NCBI
AGUCGCAGCGGUGACCGCGGGCGGGUGGGGCGCCGGGUGAAGAAACCAA… 1685 nt 0.5056
Summary

This gene encodes a voltage-gated protein channel protein expressed more highly in certain cells of the immune system. Phagocytic cells produce superoxide anions which require this channel protein, and in B cells this same process facilitates antibody production. This same channel protein, however, can also regulate functions in other cells including spermatozoa. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012] CIViC Summary for HVCN1 Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.