Basic Information

Symbol
HYAL1
RNA class
mRNA
Alias
Hyaluronidase 1 LUCA1 HYAL-1 Hyaluronoglucosaminidase 1 Lung Carcinoma Protein 1 Hyaluronidase-1 EC 3.2.1.35 LuCa-1 Hyaluronoglucosaminidase-1 Tumor Suppressor LUCA-1 Plasma Hyaluronidase Hyal-1 MPS9 NAT6
Location (GRCh38)
3:50299883-50312890
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033159.4
Sequence length
2031.0 nt
GC content
0.5736

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-783.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -815.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 497.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_033159.4 NCBI
CCUUCCUCCAGGAGUCUCUGGUGCAGCUGGGGUGGAAUCUGGCCAGGCC… 2031 nt 0.5736
NM_153281.2 NCBI
AGAUGUGGGGAGCGCCUCUGCCCUGUCGCCCCGUCCGGGAUGUGAGGAG… 2325 nt 0.5755
NM_153282.3 NCBI
CCUUCCUCCAGGAGUCUCUGGUGCAGCUGGGGUGGAAUCUGGCCAGGCC… 1941 nt 0.5714
NM_153283.3 NCBI
CCUUCCUCCAGGAGUCUCUGGUGCAGCUGGGGUGGAAUCUGGCCAGGCC… 1674 nt 0.5663
NM_153285.3 NCBI
CCUUCCUCCAGGAGUCUCUGGUGCAGCUGGGGUGGAAUCUGGCCAGGCC… 1256 nt 0.5446
Summary

This gene encodes a lysosomal hyaluronidase. Hyaluronidases intracellularly degrade hyaluronan, one of the major glycosaminoglycans of the extracellular matrix. Hyaluronan is thought to be involved in cell proliferation, migration and differentiation. This enzyme is active at an acidic pH and is the major hyaluronidase in plasma. Mutations in this gene are associated with mucopolysaccharidosis type IX, or hyaluronidase deficiency. The gene is one of several related genes in a region of chromosome 3p21.3 associated with tumor suppression. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the HYAL1 mRNA expression was significantly suppressed in both triolein injection and femoral fracture groups at 20 hours post-procedure, indicating its role as an indicator of vascular endothelial damage in a fat embolism model [Kuwata DOI:10.1016/J.Legalmed.2024.102531]. In a separate study, the orthologue of the HYAL1 was found to be up-regulated in both human and rat skin following UVB-induced inflammation, with a fold change of 20.5 in human and 6.2 in rat skin, highlighting its involvement in extracellular matrix degradation during inflammatory hyperalgesia [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].