Basic Information

Symbol
IARS1
RNA class
mRNA
Alias
Isoleucyl-TRNA Synthetase 1 ILRS IARS Isoleucine TRNA Ligase 1, Cytoplasmic Isoleucine--TRNA Ligase, Cytoplasmic Isoleucyl-TRNA Synthetase EC 6.1.1.5 IRS EC 6.1.1 PRO0785 GRIDHH ILERS IleRS
Location (GRCh38)
9:92210207-92293854
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002161.6
Sequence length
4483.0 nt
GC content
0.4334

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1292.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1376.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1058.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001374299.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4408 nt 0.4333
NM_001374300.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4578 nt 0.4360
NM_001374301.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4399 nt 0.4335
NM_001378569.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4716 nt 0.4355
NM_001378571.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4504 nt 0.4338
NM_001378572.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4504 nt 0.4323
NM_001378573.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4465 nt 0.4320
NM_001378574.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4530 nt 0.4327
NM_001378575.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4570 nt 0.4313
NM_001378576.1 NCBI
GUGCGCCCGGUUGCAGCGUGGACGCCGGAUGAGUUGCUUUUAGGCUUGC… 4563 nt 0.4315
Showing 1 to 10 of 21 entries
Summary

Aminoacyl-tRNA synthetases catalyze the aminoacylation of tRNA by their cognate amino acid. Because of their central role in linking amino acids with nucleotide triplets contained in tRNAS, aminoacyl-tRNA synthetases are thought to be among the first proteins that appeared in evolution. Isoleucine-tRNA synthetase belongs to the class-I aminoacyl-tRNA synthetase family and has been identified as a target of autoantibodies in the autoimmune disease polymyositis/dermatomyositis. Alternatively spliced transcript variants have been found. [provided by RefSeq, Nov 2012]

Forensic Context

A study in the blowfly *Calliphora stygia* identified 22 candidate ionotropic receptors (IRs) in adult antennae, including co-receptors IR8a, IR25a, and IR76b, and representatives from 10 of 13 conserved antennal IR groups [Leitch et al. DOI: 10.1186/s12864-015-1466-8]. A study in the blowfly *Calliphora stygia* identified 22 candidate ionotropic receptors (IRs) in the antennal transcriptome, including co-receptors IR8a, IR25a, and IR76b, and representatives from 10 of 13 conserved antennal IR groups [Leitch et al. DOI:10.1186/s12864-015-1466-8].