Basic Information

Symbol
ICAM2
RNA class
mRNA
Alias
Intercellular Adhesion Molecule 2 CD102 ICAM-2 CD102 Antigen
Location (GRCh38)
17:64002594-64020635
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001099789.2
Sequence length
1135.0 nt
GC content
0.5780

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-441.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -462.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 341.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000873.4 NCBI
AGACCUGCGCCCACCAUCUCCCUCCAGGCAGCCCUUGGCUGGUCCCUGC… 1051 nt 0.5804
NM_001099786.2 NCBI
GAGAAGACUGAAUAAGCCGUGAACUGGGCAGCUGUGACACGCGCACCUU… 1334 nt 0.5720
NM_001099787.2 NCBI
GAGAAGACUGAAUAAGCCGUGAACUGGGCAGCUGUGACACGCGCACCUU… 1252 nt 0.5727
NM_001099788.2 NCBI
GAGAAGACUGAAUAAGCCGUGAACUGGGCAGCUGUGACACGCGCACCUU… 1217 nt 0.5768
NM_001099789.2 NCBI
GAGAAGACUGAAUAAGCCGUGAACUGGGCAGCUGUGACACGCGCACCUU… 1135 nt 0.5780
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the intercellular adhesion molecule (ICAM) family. All ICAM proteins are type I transmembrane glycoproteins, contain 2-9 immunoglobulin-like C2-type domains, and bind to the leukocyte adhesion LFA-1 protein. This protein may play a role in lymphocyte recirculation by blocking LFA-1-dependent cell adhesion. It mediates adhesive interactions important for antigen-specific immune response, NK-cell mediated clearance, lymphocyte recirculation, and other cellular interactions important for immune response and surveillance. Several transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans using post-mortem RNA sequencing of six tissues from sepsis patients identified the ICAM2 as downregulated in the kidneys and lungs as part of the inhibited extracellular matrix organization pathway in sepsis [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].