Basic Information

Symbol
ICAM4
RNA class
mRNA
Alias
Intercellular Adhesion Molecule 4 (Landsteiner-Wiener Blood Group) CD242 LW Intercellular Adhesion Molecule 4 (LW Blood Group) Landsteiner-Wiener Blood Group Glycoprotein Intercellular Adhesion Molecule 4 CD242 Antigen Intercellular Adhesion Molecule 4, Landsteiner-Wiener Blood Group Landsteiner-Wiener Blood Group Antigen A Landsteiner-Wiener Blood Group LW Blood Group Protein Bloodgroup LW Protein LW Antigen A ICAM-4
Location (GRCh38)
19:10286955-10288522
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001544.5
Sequence length
1290.0 nt
GC content
0.5984

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-523.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -543.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 285.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039132.3 NCBI
AUCUCUAGAGCCGGCCCUGGCUCUCUGGCGCGGGGCCCCUUAGUCCGGG… 1213 nt 0.6002
NM_001544.5 NCBI
AUCUCUAGAGCCGGCCCUGGCUCUCUGGCGCGGGGCCCCUUAGUCCGGG… 1290 nt 0.5984
Summary

This gene encodes the Landsteiner-Wiener (LW) blood group antigen(s) that belongs to the immunoglobulin (Ig) superfamily, and that shares similarity with the intercellular adhesion molecule (ICAM) protein family. This ICAM protein contains 2 Ig-like C2-type domains and binds to the leukocyte adhesion LFA-1 protein. The molecular basis of the LW(A)/LW(B) blood group antigens is a single aa variation at position 100; Gln-100=LW(A) and Arg-100=LW(B). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.