Basic Information

Symbol
ICMT
RNA class
mRNA
Alias
Isoprenylcysteine Carboxyl Methyltransferase PCCMT PPMT Protein-S-Isoprenylcysteine O-Methyltransferase HSTE14 Prenylated Protein Carboxyl Methyltransferase Prenylcysteine Carboxyl Methyltransferase EC 2.1.1.100 Isoprenylcysteine Carboxylmethyltransferase MSTP098 MST098 PcCMT PCMT
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_012405.4
Sequence length
4795.0 nt
GC content
0.4986

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1896.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1979.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 982.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((..((...((((.((((((((((((((((...((((....))))...)))))))).).))))))).))))..((.((((.(((((((((...(((((..............)))))))))))))).))))))((((((((((((((.(((.((.((((((((((.((.(((.(((((..(((((((.((..((((((((.(((.(((.((((((((((((((((((..((...))..)).)))))....((((((((((((...(((((((((.((.(((((((((.(((((((..(((((((((((((..(((((((((.((((((((((((((((.(((..((((((((((((.........)))))....))))))).)))))......(((((.((((((((..(((........)))...((((((((((((((((.........))))))....(((.((((((((((((....))))......)))))))))))(((((..(((.....)))..)))))......)))))).))))(((((((((((((.....))))))))((((((....((((..((.(((((((.............((((...((((((((.((((((.........)))))).....(((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((..(((.((((......)))).)))((((((((............)))))))).(((((((.......)))))))..((((((..(..((.....)).)..))))))..(((.((((.........)))).))))).))))))).)))..)))..))))))))((((((.(((((((((........))..))))))).))))))..((((((((((....(((.((((((..(((((.(((((((...((((((((((..((((((.(((((.((((....((.((.((.((((((..(((((((...(((...(((.((...........)).)))...))).))))))).)))))))))).))......))))..))))))))))).))))))............))))...))).)))).............(((((.......................)))))((((......))))))))).)))))).)))..))))))))))..))))))).))))).(((...((....))...))).(((((((.(((.....))).))).)))).))))))))).((.((((((((((.....))))))))....)).)).(((((......)))))....)))))))).)))).....(((((.((((....(((((((.((((((.((((..((((((.(((((..(((((...............((((...))))..((((((.....................(((((.................)))))..............(((((....((((((...((((((.(((....................))).)))))))).))))...)))))....((..((((((((.(((..(((((((((((((((((.......)))).))))))....(((((((.....(((((((....)))))))......((...((((.((.((.(((.((((((((..(((((......))))).....))))).....)))))).)).)).))))...))((((((((.....(((....((.....(((((......)))))....))...))).....))))))))......))))))).((((((.(.........).))))))...)))....))))..))).)))).))))..))..........))))))(((((((((.........)).))))))).....((((((.(((.........................((((....))))))).)))))).)))))..)))))))).)))..)))).)).)))).((((((((........))))))))..)))))))..(((((((.((((((((((...))))(((((.(((.((....))..))).)))))(((((((....))).))))((((.....)))).....)))))).)))))))((...((((((((((.....)))))..))))).))..)))).))))).)))))))))))))....))..)))).((((((.(((....)))...))))))....)))))..((((((((.....)))))))).((((((((((((........)))))))....))))).((((..(((..(((((.............)).)))...))).)))).....)))))))).))))).....)))))))).....((((((((.(........).)))))))).....(((((((((.....))))))).))....(((((..((((((....))))))))))).....)))))).))))).))))......))))))))..))))).)).))).))))))((((.((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((...(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((....(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.(((((((((.(((((((((((((((.((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((.(((((((((((((...............................(((((....((((((((((...((((((..(((((.((.((((((((((..((.(((.((((((((((...)))))).............(((..((((((((...((((((....)).))))...........(((((((((..(((......))))))))))))..))))))))..))).))))..)))))....))))))).((((((.((((((.(((((..(((((((((.......)).)))))))..)))))(((...)))(((((.....)))))((((((((....))))))))..((((.((..(((((...)))))....)).)))).....))).))).)))))))))))))))).((((((..(((((.(((((.(((..(((..(((...((((((...)))))).((((.........))))..)))..)))..))).)).))).)))))...))))))..))).)))...).)))))))))...)))))..........(((((.((.((..((((.....))))..))..((((((((((.((.........(((((.((((..((......))..)))))))))........)))))))))))))).)))))....((((((((.((((((((.....)))))))).....))))))))..))))))))))))).)))))).......)))))))))))).))).)))))))))))))).))))))))))))))).))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))....)))).))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))...)))).)))))))))))))))))))).))))))))))..)))))))).))))).))))))))))).)))))))))))))))))))))))))).))))))))))).)))))))))....))))))).))))).((((.....))))......((((..((((((....))))))....))))..........)))))))))))))).))).)))..(((......)))(((...((((((...((((.....)))))))))).....))).....((((.((((.(((..(((.(((..((........))..))))))..))).)))).))))((((((((((.........)))).))))))........))))).....)).))))))).)))))...))).)).))))))))))))))))))))))).............((((..((((((.(((((((((((.((((((...(((((.((((((.....................)))))))))))((((((.....)))))).((((.(((((((..(((........)))..))))))).)))).....((((....(((((((((..(((..(((((((..((((.....))))...........)))....))))..))).)))))))))))))..........((((.......))))(((...(((((.((.............))))))).)))((((((.((((((...........))).)))..))))))......((((....)))).)))))).))))))).)).)).))).)))..)))).(((((((((((((.(((((....)))))((((((...)))))).))).)))))))))).))))))..........))..)))))(((((((...((((((((((.(((.................(((((((....)))))))......((((......)))).)))...))))))))))...))))))).............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((,((((((..((((.((((((({((((((((...((((....))))...)))))))).).))))))).)))).(({{((((.(((((((((...(((((..............)))))))))))))).)))))))(((((((((((...{.(((((((((((..(,....}.,))))))))))).}...((((((((,,.....({((.,,.}}.)).},....}))))))).((((((((((((,,,.....,.,(((({{({{{(((((((((.((.(((((((((.(((((((..{((((((((((((..(((((((((.((((((((((((((,,.(((..((((((((((((.........))))}...,))))))).))}},......(((((.((((((((,{(({{,,,.,,,,||.|,||{{{{{{{,{{{{{,,.{{(((((((((,,...(((,,((((((((((({....})))......)))))))))))}..||})))).}}}}}}),|||,||,||,|||}{((|({{||((((((({(((((,..,,||||||||{({(((,.,.({{,..||,||{||||...{{{,{{(....||}...{{{||||,.{||||{......,.,)))))},,,,.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.(({,.({.((((......))))||,((((((((({..........,))))))))){||{{((,......}})}))),,((((((..(..((.....)).)..)))))}.}|{{.{,{{.........,,))}))))).))))))).))}.,))).,))))))))((((((.((((((({(........},..))))))).))))))..((((((((((....(((.((((((..(((((.(((((((...((((((((((..(((({{{(((((.((((...,((.((.((.((((((..(((((((...(((.,.(((.({{{{...}}}..)}.))).,.))).))))))).)))))))))).)).,....))))..))))))))))).))))))............))))...))).)))).............(((((.....................,,)))))((((......))))))))).)))))).)))..))))))))))..)))))))}))))),(((...((....))...))).(((((((.(((.....))).))).)))).}))))))))...{({((((((((.....)))))))))),,,,,}||||.,,.,,,...,|||....||||}}},.,,,},....(((((.((((....(((((({.{{({((.((((..((((((.(((((..(((((.............,.((((...)))).|(({((({,,,,...............,(((({.,,..,........,,.))))}.,,..........}|||||,,..{{{(((...((((((.(((...,{..........,....))).))))))))},}})|..,,})}....((..((((((((.(((..{((({{,((((((((((.......)))).)))))),...(((((((.....(((((((....)))))))......((...((((.((.((.(((.((((((((..(((((......))))).....))))).,,,.}}}))).)).)).))))...))((((((((.....(((....((..,..(((((......)))))....))...))).....))))))))......))))))).((((((.{.........}.))))))..........))))..)}).)))).))))..))...,{|,,,.}}}}}}(((((((((.........)).))))))),|||||{((((,{.........,{{(({{...,{{{,...,|}}......))))))),)))),)))))..)))))))),,))..)))).)).})}}.((((((((........))))))))..})))))).,(((((((.(((((({({{...},},(((((.((({((....)).}))).))))){({((((....}))},)))((({.....)))),,,..)))))).)))))))((...((((((((((.....)))))..))))).)),,)))),))))).))}))))}},}}}....},}})))}.((((((,(((....,))...))))))...,})}))..{{{{{{{|..,,.)))))))).|||||(((((((........)))))))....)))))|||{|},|||.,||||,.,,.....|||},}},}}},.})}}}},}}.....)))))))).))))).....)))))))).....((((((((.{........}.)))))))).....({(((((((.....))))))).)}....((({{.,((((((....)))))))}}}).....)))))).))))).))))......)))))))}.,)))}}.)).))).))))))((((.((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((.,.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((....(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.(((((((((.(((((((((((((((.((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((.(((((((((((((...............................{((((....((((((((((...(((((({.(((((.((.((((((((((..((.(((.((((((((((...)))))}.............{((..((((((({,,,.(((({....}}..})),..,,,,,,..(((((((((..(((......))))))))))))..))))))))..))},))))..)))))....))))))).((((({.((({{{.({(((..(((((((((.......)),}))))))..)))||{{{{,.|,(((((......}}}}|(((((({,.,,,))))}|||,...||}|,..|||||...)))))}|...,{{,,,,||},}}}.))).}))))))))))))))).((((((.{(((((.(((((.(((..(((..(((.{.((((((...)))))).{(((.........)))),.)))..)))..))).)),))}.))))),}.))))))}.))).)))...).)))))))))...))))}...,,|||,.{((((.((,((..((((.....))))..)}..((((((((((.((.......{{((({(.((((..((......))..)))))))))}.......)))))))))))))).))))}.,,.(((((((({((((((((.....))))))))}}},.})))))))..))))))))))))).))))))}}},...,,,})))))))).))).)))))))))))))).))))))))))))))).))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))....)))).)))))))))))},))))))))))))))))))))))))))))))).,.)))).)))))))))))))))))))).)))))))))}.,)))))))).))))).))))))))))).)))))))))))))))))))))))))).))))))))))).)))))))))...}))))))))))))))},))))..{{{{.......))}}..(((({(....)))))}.,|||......},,,...))))))))))))))))).)))||(((((((....(((((..(((((((((({...,,,..(((({{{{((((...........((((.((((.(((..(((.((({,((......,,))..)))))).}))).)))).)))){(((((((((.........)))).)))))}...,{({{|(((,...|||..,|||{{{{((({{((,,,|}|||}}}{|{{({(((({{{,}}||}|.{,,{,{{{(((((({{({.{{||||{||||||,{{{(((|(({,,.(((((.((((((,.....,............,.)))))))))))((((((.....)))))).{{{(.(((((((..(((........)))..))))))).))}}.,...((((....{{(((((((..(((..(((((,{..((((.....))))..,...,..,.,))...)))))..))).)))))))},,)))}.,|....{.((((.......)))),...,,..,,}..}))}}}})))}..})))}}},,|||}}}})}),,,},....,,|},,})))))))))))))),),)))))))))))..))))),((.((.(((((((({(.((({,.....,))(((.(((((((((((((.(((((....)))))((((({...}))))).))).)))))))))).))).})}}.)))))..))).,)),)|((((((.,.((((((((((.{{{.................{((((({....)))))}}......{|{{......}}},.)))...)))))))))).,.))))))}.............)))))))},.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUUUCUCCGGGCUACAGCCGGCGCCGCCGCCCGCUAGUCCGCCGCCCGG… 4795 nt 0.4986
Summary

This gene encodes the third of three enzymes that posttranslationally modify isoprenylated C-terminal cysteine residues in certain proteins and target those proteins to the cell membrane. This enzyme localizes to the endoplasmic reticulum. Alternative splicing may result in other transcript variants, but the biological validity of those transcripts has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.