Basic Information

Symbol
ICOSLG
RNA class
mRNA
Alias
Inducible T Cell Costimulator Ligand B7RP-1 B7-H2 B7RP1 B7H2 B7-Related Protein 1 B7 Homolog 2 KIAA0653 ICOS-L CD275 ICOSL GL50 B7h B7-Like Protein Gl50 B7 Homologue 2 ICOS Ligand Transmembrane Protein B7-H2 ICOS Ligand Inducible T-Cell Costimulator Ligand CD275 Antigen IMD119 LICOS
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Chronological age estimation

MANE select

Transcript ID
NM_015259.6
Sequence length
7078.0 nt
GC content
0.5901

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3145.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3254.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1538.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((..(((.....)))..))))...((((((((((((((((((.(((...(((((..........)))))..((((.((...(((((...(.(((((.(((((...((((((....((((((.(((((((((((((((((...)))))).((((((.(((((.((((((......))))...)).))))).))))))((((.((..(((((((..((((.(((.(((...))).)))))))))).(((((.((.((((((...........((((.((..((((((....))))))...)).)))).((((((...))))))......)))))).))))))).......((((....)))).......)))).)).)))).....)))))).))))).))))))..))))))...)))))...((((((((.......(((((..((((....)))).....))))))))))))).(((((((((....))))).))))......(((((((((...((((.....))))..)))))))))((((..(((.(((((((.(.((((((((.......(((((....(((......)))..)))))......))))....(((((((..(((((......((((.(((((((....((..((((.(((......)))))))..))...))))))).)))))))))..)))))))......))))...).))))))).))).))))))))))...))))).)).))))((((((((..(((......))).))))))))..((((.(((.(....).))).))))....))).)))))))).))...........(((((((.((((((((.(..((((((.....((((......((((((((((((((((((.(((((((((((.((((((((..(.(((((((((..(((((((((.(((.....((((.((.........)).))))((((((((.((((((((((((((...(((....)))...))))..))))).))))).)))))).))..(((((((((.((.....)).)))...(.(.(((((..((((((((...(((.(.(((.....((((....((((((...((((((....))))))..((((((....))).))).((((((...((((((((.(((((((.((.((((((.(((.((..........)).))))))........(((....((((((.((((((((((...)))))..)))))(((((((.((........))))))))).((((((.((((((((((((.(.((((((((...(((.....)))..)))).)))))))(((((((...)))))))((((((.....)))))).((.((.(((....))).)).))...............((((((....(((((((((((((((((((((((.....)).)))).))))))))..((((((((((((((....(((((..(((......))).)))))..))).((.(((.....))).))....((((..((((((.((((....)))).))).))).....)))).......(((((((..((......))...))))))).))))))))))).......)))))))))....))))))(((((((.(((....))).)))))))((((((.((.......)).)))))).....(((........)))..(((..((((.((((((..((.(....(((((.((((((...))))))))))))))..)))))).)))).)))))).))))))))))))).(((......((((((((.(((((...(((((((.((((((((.(((((.....(((((((.....(((..((((((((((((....((((((((((((((.(((....)))........)))))))).)).....(((((((..........(((((((................(((.(((((....(((((........)))))..)))))))).....(((((....))))).......((....))((((((...((((((((((.((.(((.((((......)))).))).))))))).)))))...))))))..((((((((.......)))))))).)))).))).........)))))))...)))))))))))))))))))...)))))))..((((((((.((((((....(((((((((..((((((.((((.((.......)).)))))))))).(((((....(((((...........(((((.((.(((((.((((((((((((((((((((.(........).))))))...(((((..((((((((((.((((.(((.((((((((......................))))))))))).))))....(((...(((((((..((((((......(((((.....))))).......))))....))..)))))))...)))...((((((.....))))))....(((((.(..(((((....))))).).))))).........))))))))))....(((((((.((((.(((((((..((((((((.((((((..(((......((((((((.(..(((((((..((((((..(((((((...)))))))(((((..((((.(....(((.((((((.(((((.((((((....(((.((((...((((.(((...))).))))....)))).)))))).))))))))..((((((((.....((((((..(((((.(((...(((..((((((((((.(((((...((((((......))))))......(((.....)))(((((.((((......(((((.((((((((...(((((((((((((....)))))).)))))))....)))).)))).)))))....)))).)))))..))))).))))))).)...))..)))...))).)))))..))))))))))))))..)))))).)))..).))))...)))))...))))))....)).)))))..).)))))))).....)))..))))))...)))).)))).....)))))..(((.(((..(((((..(((((....)))))))))).))).)))....((.((((....)))).))..)).)))))))))))..)))))))))))))).)))))))))).)).)))))(((((.((((...)))).)))))....((((((((...........)))))))))))))....)))))....))))))))))))))).)))))).))....((((((.((.(((((((.....(((((.((((..((.((((((((.....)))))...(((((((((.((.((.....(((((.....(((((((....)))))))....)))))...)).)).)))))))))..........(((((((.....)))))))..))).))..)).))))))))))))))))...))))))).))))..)))))))).)))).)))))))))))))))).....)))..))))))....))).(((((((...(((((.....))))).)))))))......((....)).))).))))))))).)))))))).((((((((((((((((((.((((((.(.(((..(((.....((((((((((.(....).)).))))))))(((....)))((((((.(((.(......).))).))))))((((((....(((.((((((...((((((((..(((((((((((((.(((.((((((..(((.((....)).)))..))).)))))).)))...)).)))))))).)))).))))...))))))..)))..(((((((((.(((((..((((((((((((...((((.....))))(((((((.(((((((.(((((((..(((......))).))))))))).((((....))))))))))))))))(((.((..((....)))).))).............(((((((.....))))))).)))))))))...)))))))).)).)))))))...(((((((........))).)))).))))))..(((((((......)))))))....(((((((((..(((...(......)...))).)))))))))...)))..))).)))))))..)))))).)))))))))))).....)))))).....))))))...))))))).))))..))))))))...))))).).).....))))))))).))))).))))..)))((((((((.....((((((.......(((.(((....((((((((((.........((((.(((((.............((((((((((((((((((((((((((.(((((...(((((...............(((((((.((((...((((((((((((.(((((((..(((.(((......))).)))..((((.((..(((.....))).))))))..(((((((((.((............))..)))))))))..))))))).))((((.(((((((.(((((((((((.....))))))))(((.(((...(((....)))((((((.(((...))).)))).)).((((.((.(((.(((((((.((((((((.......)))))))).))))..)))..))).)).)))).....)))))))))..))))))).)))).)))))).))))...)))).)))))))(((.(((((((((((..(((((....(((((((((...(((......((((((((...)))))))))))...)))))))))...))))).))))).....))))))))))))))...))))).)))...))).))).)).)))).))....((((.((.....((.(((.(((...)))...))).))...))))))...)))))))))..((.((((....))))))....))).)).))))...(((((..((((...))))..)))))....((((...(((((...((((..(((.(...(((.................)))..).)))))))...))))).)))).((((.......)))).)))))).))))...))).)))........))))))...((((......)))).))))))))...))))))).))))))))))))))).....((((.(((.(((.((((.((((..........)))).))))))).))).((((.(((((((((((.(.((((...((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((.(((((((((((...(((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((..(.(((((((((((((((((((((..(((((((.((((((((((((((.((((((..((((((((((((((..((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((((((...........((((..((......))..)))).........((((((...(((((((.((((((((.((((..(((.....)))...........((((((.((((......))))..))))))..)))).)))))))....((((.((((.((((((((.(........))))))...))).))))))))(((((((.......)))))))).)))))))...))))))))))))))..))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))..))))))))))))))..)))))).)))))))))))))).)))))))..)))))))))))))))))..)))).)..)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).((((..((((((...((((((..(..(((..((((((((((((...)))).))))))))))))..)))))).....))))))..))))...............................((.(((((.((((((.....)))).))...))))).))(((((....))))).....))))))))))))...))))))))))).)).))))))))).))))))))))........))))))))))))))))))))...)))).).))))))))))).))))............((((..(((..........))).)))).)))).)))).((((((((((((((((((..(((((((((((.....((((((((((((...(((((((....(((((((.(((((((((..(((((((((((((.(.......(((((.(((....)))....(((((((((((((.((....((...(((((((....)))).))).))..)).))))))))).)))))))))((((((((((...))))))))))....).))))))...(((....)))....))))))).)))))).))).))).))))..))))))).)))))).))....))))((((.(((((.(((((....)))))............((((.(((..........))).....))))((((.(((((((..((((((..((((....)))).)))))))))))))..))))...))))))))))))))))))))....))))).))))...))))))))).....(((((..(((((((............)))))))))))).)))))))))))))..(((.(((..(((((....)))))..))).)))(((((...)))))(((........)))((((....)))).....)))))..))))))))))))))))))).)))))))..))))))))........(((.(((....))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{.,...({(,,,.,}},.,),}}...((((((((((((((((((.(((..{{((((....,{.,,{|||||{.,,({{{{,{{,||||...|,||||}}|||||,..{{{{{{.,,,{(((((.(((((((((((((((((...)))))),{{{((({(({{{.{(({{(,,,,..}||||...}}))}}),)))|,|((((.((..{(((,(({{(((,.(({.{{{...))),)))}}))}||.(((({{((.((((((........,.,((((.((,.((((((....)))))}...)).)))).((((((...))))))......)))))).)))))))||....,((((....))))..,,,..}}}}.)).)))},..,.))))))}})))).))))))|.)}}}))..,}||}|{,{(((({{{{,......{{{||,|||{{,{..,,,,,.}}}}}||||}}}}}}}|{{{{(((((....))))).)))},,}.||(((((((((...((((.....))))..)))))))))((((..(((.(((((((,{.((((((((.......(((((.,,.({{......)}),.)))))......))))....(((((((..(((((......((((.(((((((....((..((((.(({......))}))))..))...))))))).)))))))))..)))))))......))))...).))))))).))).))))||,,,,}}.)))))}}}.}|||(((((({(,,({(....,,||,.}}}))))}..,||,.|||||}}}})}))).)))),...))).)))))))).))}.......|..(((((((.((((((((.{..((((((.....((((....,.((((((((((((((((((.(,((((((,((.(((({((({{(.((({{{{((((((({({((((((,,....{{.,.,......{,..{{{,((((((((((({,((((((,((.,,,.({(((,...||,{,.,,,}}.))))))))),,.}},,.|{|,(((((.(((((...((((,((({.....,.(.(((((..((((((((...(((.,.(((.....((((....((((((...{(((((....))))))..((((((....))).))).((((((...((((((((.(((((((.((.(((((,{(((.((..........)).))))))........(((....((((((.((((((((((...))))),.}))))(((((((.((........))))))))).((((((.(((((,.,,{((,(.(((({{{,...{|{.,..,)))|.||}}.}||}|||(((((({...})))))){(({({,,,.,)))))).{{,{{{((({{{.}},.))}))}}}.....,,|{{{((({{{{|}|{|||||..(((((((.{(((((((.(((((....((.(((((.({{....{((({..((....((((.((......))))))..)),))))})}..))))).))))))).))}}))))}....((({{(.((((....)))).))).}))..)))))))...,{|||||||((((((.((((((({{{({,,..)}}}){{{{{.,(((,,,.,,,|||}}|||......}}}(((((((.(((....))}.)))))))((((((.((.......)).)))))).....(((,,,.....|||{.|.|}}|)),,,,,)})))).,,.)))))).))))))}|}}}}}{{{,...,,)))...,...((((((....))))))))))))))))}.{((......((((((((.(((((...(((((((.((((((((.(((((,....(((((((.....(((,.{(((((((((((....{(((((((((((((.{{{....|},........)))))))).)).,,,.(((((((......,..((((((({....,,,,..,,..,,(((.(({{{,,..{(({{.{,.....}}}}|,,|}}}||||,,...(((((....))))).....,.{{...,))((((((.,.(((((((((,,((.(((.((((......)))).))).))))))},))))).,.))))))..|||||{{{.,,,...}}}))))))))))},||....,}}..)))))))...))},)))))))))))))))...))))))).,((((((((.((((((....(((((((((..((((((.((((.((.......)).)))))))))).(((((....(((({...........(((((,,(.(((((.((((((((((((({((((((.,,,,....,).)))))).,,{((((..((((((((((.((((.(((.((((((((......................))))))))))).)))),{{{(,{...{((({,{..(,((((......(((((.....))))).......))))...,}}||}))))))..,}}|,,.((((((.....)))))).|||{((((.{..(((((....))))).}.))))}.........))))))))))....((((((,{((({.(((((((.,((((((((.((((((..(((..,...((((((((.{.,(((((({,.{{{||||,,||{{(({.{((,,..}}|,}},.||{{,,||,|||}||{||||||||,{{((((((....{{{||||||,{{{{{.......{|||.||||||,,,)))})},)))}})))))}|.,{||||||||{((((((((..(({(({{{,...(((((((((((((((.(((((...((((({......,)))))......(((.....)))(((((.((((....,.(((((.((((((((..{{{{{((((((((,{{{{,,,,))}),)))))}),|}})).)))).)))))....)))).)))))..))))).)))))))|{{{{{|{{.,,))}).,}))))))))))))})))}}|||,.},,,.}})}}..},)))))}))}|{||.,,}}..,)))))).}}}})..).)))))))).....)))..))))))...))))},)))...,.))))}..(((.(((..(((((..(((((....)))))))))).))).)))....{{.((((....)))).}).,)).}))))))))))..))))}))))))))).)))))))))).}),)))))(((((.((((...)))).)))))...,((((((((...,......,)))))))))))))....)))))....))))))))))))))).)))))).)).,..{(((((.((.(((((((.....(((({{((({..((,((((({{{..,,,}||||...(((((((((.((.((.,,{,{({{{...,,||{((((....||||}},.,,,)}))),,.)}.)).))))))))).,|,,..,,,{((((((.....)))))))..))),)}..)),)}))))))))))))))...))))))),))))..)))))))).))))},)))))))))))))))...,.)))..))))))....))).(((((((.{,(((((.....)))))}))))))).....,((....}))))).))))))))).)))))))).((((((((((((((((((.((((((.(.(((..(((.....((((((((((,(...,).))}}))))))),{{....,||((((((.(((.{......).))).))))))||((({....(((.((((((...(((({(((..(((((((((((((.{((.((((((..(((.((....)).)))..))).)))))}.)),..,)).)))))))).}})).))))...))))))..)))..(((((((((.(((((..((((((((((((...((((.....)})|(((((((.(((((((.(((((((..(((......))).)))))))}),((((....))))))))))))))))|{{.,,..|||,..}}}}}}},...},........(((((((.....))))))).)))))))),..,)))))))).)).)))))))...{(((({(,,,,....}}}.)}}).))}})),.{((((((......))))))}....(((((((((..(((.{,,,.....)..,))).))))))))}.,.)))..))),,))))))..)))))).)))))))))))).....)))))).....))))))...))))))).}))).,))))))))...))))).}.,.....,)))),},))))....)))))...)))))|}}{,,,{,,(((((.((({,.(((((((((,.,,.{{,,.,(,(((,(((((..........,{{{....{(({.((....(((((((((((((((((((.(((((...(((((...............(((((((.((((...(((((((((({{.(((((((..(((.(((......))).))||,((((,{{...,,.....},),)))))){,{((((((((.((............))..)))))))))}.))))))).}|((((.(((((((.(({((((((((,...,))))))))(({{{{{..,{{{....||}((((((.(((...))).)))).)).((((.((.(((.(((((((.((((((((.......)))))))).))))..}))..})).)).)))}.....}}})))}))..))))))).)))),)))))).))))..,)))).)))))))(((.(((((({((({{,(((((....(((((((((...(((......((((((((...)))))))))))...)))))))))...))))).},,}).,}}.))))))))))))))...))))),)))...))).)))},).)))).))))....}}..))))..)}))........))))}.})).))........,..}.)))))))))..||}|,||},|,||}|||....))))),}))))...(((((..((((...))))..))))).}}.||||},..,))))})))))))|||.|}}}||}.....,,}}).......}},..,)))),))),},)))}},}))),)))),)}.))})))}|{{|.||.|,|||...)),.})}..|||,.,{((((((((({({{{{{..(((({..(((((.,...}),))))).))))),,))},},....|{,,.{({.(((.((((.((((..........)))).))))))).}}}.{(((.(((((((((((.(.((((...((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((.(((((((((((...(((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((..(,(((((((((((((((((((((..(((((((.((((((((((((((.((((((..((((((((((((((..((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((((((,,.{,......,{{|,.,.,||...,....,}}....,,...{(((((...(((((((.{(((((((.{(((,.(((.....}}}...........((((((.{(({,,....))))..))))))..}))).)))))))....((((.((((,({((((((.(........})))))}..,)).})))))))(((((((.......)))))))}.)))))))...)))))}))))))))..))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))..))))))))))))))..)))))).)))))))))))))).)))))))..))))))))))))))))),.,))).),.)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).((((..((((((...((((((..(..(((..((((((((((({...}))).))))))))))))..)))))).....))))))..))))..,,...........................||.{((((.({((((.....)))),))...))))).}}(((((....))))).....))))))))))))...))))))))))).)).))))))))).)))))))))}.......,))))))))))))))))))))...)))).).))))))))))).)))}........,{..{,{{.,{|,..........,,}.}),,.)))}.},,{{(((,,,,,((((((((((..(((((((((({.....(({{((((((((.{.(((((((....,,,.(((.(((((((((..(((((((((((((.,.{{....(((((.(({....)))....(((((((((((((.((.,..((...(((((((....)))).))).)).})).))))))))).)))))))))((((((((((...))))))))))....),)))))),..(((....)))....})))))).)))))).))),))}.,}},..))))))),)))))).))....}}))((((.(((((.(((((....)))))............,,,{.{,,....,..{{{||,....}))))((((.((((((,.,((((((..((((....)))).)))))))))))))..))))...)))))))))}))))))))))....))))).)))))})))).))))))))))|((((..(((((((............)))))))))))}.))))))))))))}..(((.(((..(((((....)))))..))).)))({(({,..,},,,|||........)))((((....))))....,)))))..))))))))))))))))))).))))))).,))))))))........(((.(((....))))))......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCAGUUAGAGCCGAUCUCCCGCGCCCCGAGGUUGCUCCUCUCCGAGGUC… 1112 nt 0.5818
GCAGUUAGAGCCGAUCUCCCGCGCCCCGAGGUUGCUCCUCUCCGAGGUC… 6727 nt 0.5921
GCAGUUAGAGCCGAUCUCCCGCGCCCCGAGGUUGCUCCUCUCCGAGGUC… 6926 nt 0.5921
GCAGUUAGAGCCGAUCUCCCGCGCCCCGAGGUUGCUCCUCUCCGAGGUC… 7414 nt 0.5901
GCAGUUAGAGCCGAUCUCCCGCGCCCCGAGGUUGCUCCUCUCCGAGGUC… 7580 nt 0.5912
GCAGUUAGAGCCGAUCUCCCGCGCCCCGAGGUUGCUCCUCUCCGAGGUC… 7078 nt 0.5901
Summary

Enables identical protein binding activity and receptor ligand activity. Involved in T follicular helper cell differentiation. Located in intracellular membrane-bounded organelle. Is active in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A review of human multi-omics studies for biological age estimation identified the ICOSLG as a proteomic aging biomarker with higher abundance in the age-dependent urine proteome of healthy men [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192]. In a separate study, a single-cell transcriptomic analysis of radiation-induced lung injury in a rat model identified the orthologous rat gene for the ICOSLG as being associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].