Basic Information

Symbol
IDH2
RNA class
mRNA
Alias
Isocitrate Dehydrogenase (NADP(+)) 2 IDH-2 Isocitrate Dehydrogenase (NADP(+)) 2, Mitochondrial Isocitrate Dehydrogenase 2 (NADP+), Mitochondrial Isocitrate Dehydrogenase [NADP], Mitochondrial Oxalosuccinate Decarboxylase NADP(+)-Specific ICDH EC 1.1.1.42 ICD-M IDH IDP MNADP-IDH D2HGA2 IDHM IDPM
Location (GRCh38)
15:90083045-90102490
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002168.4
Sequence length
2658.0 nt
GC content
0.5553

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1029.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1074.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 713.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001289910.1 NCBI
AUUUUGCAACGCCAUAGGCUUCCAGCGACUGCUGGUGAUGUUUCUGAUG… 1578 nt 0.5545
NM_001290114.2 NCBI
AGCCCGCGGCCAGGCAGCCGGGAGGAGCGGCGCGCGCUCGGACCUCUCC… 2400 nt 0.5562
NM_002168.4 NCBI
AGCCCGCGGCCAGGCAGCCGGGAGGAGCGGCGCGCGCUCGGACCUCUCC… 2658 nt 0.5553
Summary

Isocitrate dehydrogenases catalyze the oxidative decarboxylation of isocitrate to 2-oxoglutarate. These enzymes belong to two distinct subclasses, one of which utilizes NAD(+) as the electron acceptor and the other NADP(+). Five isocitrate dehydrogenases have been reported: three NAD(+)-dependent isocitrate dehydrogenases, which localize to the mitochondrial matrix, and two NADP(+)-dependent isocitrate dehydrogenases, one of which is mitochondrial and the other predominantly cytosolic. Each NADP(+)-dependent isozyme is a homodimer. The protein encoded by this gene is the NADP(+)-dependent isocitrate dehydrogenase found in the mitochondria. It plays a role in intermediary metabolism and energy production. This protein may tightly associate or interact with the pyruvate dehydrogenase complex. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2014] CIViC Summary for IDH2 Gene IDH2 mutations have been observed in a number of cancer types, including sarcomas, hematologic malignancies, colon cancer and brain cancer. Mutations in the two isocitrate dehydrogenase enzymes involved in cytoplasmic (IDH1) and mitochondrial (IDH2) conversion of alpha-ketoglutarate to D-2-hydroxyglutarate have been described as mutually exclusive in many of these cancer types. The most frequent mutations involve R132 (IDH1) and R172 (IDH2) involve the active site and result in neomorphic enzyme activity. Although IDH2 (R172) mutations are associated with poorer overall prognosis in AML patients, its utility as a prognostic marker in MDS is still under debate. Additionally, IDH2 (R140) has been associated with improved overall survival in AML. IDH2 mutations have been associated with improved prognosis in gliomas.

Forensic Context

A study in mice demonstrated that exertional heat stroke induced a sustained DNA methylation memory in the left ventricular myocardium after 30 days of recovery, with the IDH2 exhibiting two strongly methylated differentially methylated cytosines near its transcription start site, though this epigenetic change did not correlate with a difference in its mRNA expression at rest [Murray et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00147.2021].