Basic Information

Symbol
IDI1
RNA class
mRNA
Alias
Isopentenyl-Diphosphate Delta Isomerase 1 Isopentenyl-Diphosphate Delta-Isomerase 1 Isopentenyl Pyrophosphate Isomerase 1 IPP Isomerase 1 EC 5.3.3.2 IPPI1 Isopentenyl Diphosphate Dimethylallyl Diphosphate Isomerase 1 Isopentenyl-Diphosphate Delta Isomerase IPP Isomerase IPP1
Location (GRCh38)
10:1039152-1049119
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004508.4
Sequence length
2739.0 nt
GC content
0.3793

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-713.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -770.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 695.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001317955.2 NCBI
GGCUUCCGCCCCGCAGCCCCGAGGGGUCUGGGCGCGCUGAAGACCCCUU… 3224 nt 0.4079
NM_001317956.2 NCBI
GUCUGUGGCCGGAGGCUGAUCAGGUACUGUGGACGGGCGGCGGAGUUCG… 3373 nt 0.4109
NM_001317957.2 NCBI
GUCUGUGGCCGGAGGCUGAUCAGGUACUGUGGACGGGCGGCGGAGUUCG… 3200 nt 0.4122
NM_004508.4 NCBI
CAGGUUCCCGGUGCUUCGCGCGUCUGCCGUUGUCACAGGCCAGGGAGGU… 2739 nt 0.3793
Summary

IDI1 encodes a peroxisomally-localized enzyme that catalyzes the interconversion of isopentenyl diphosphate (IPP) to its highly electrophilic isomer, dimethylallyl diphosphate (DMAPP), which are the substrates for the successive reaction that results in the synthesis of farnesyl diphosphate and, ultimately, cholesterol. It has been shown in peroxisomal deficiency diseases such as Zellweger syndrome and neonatal adrenoleukodystrophy that there is reduction in IPP isomerase activity. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in Apoe-/- mice demonstrated that cigarette smoke exposure upregulated the IDI1, a protein involved in cholesterol biosynthesis, within dysregulated hepatic lipid metabolism networks, an effect that was reduced upon switching to a modified risk tobacco product [Lo Sasso et al. DOI:10.3109/08958378.2016.1150368]. In human lymphoblastoid cell lines, lower baseline expression of the IDI1 was observed in individuals with alcohol use disorder compared to controls [Ferguson et al. DOI:10.3389/Fnmol.2022.1032362]. A study in Apoe-/- mice demonstrated that cigarette smoke exposure upregulated the IDI1, a protein involved in cholesterol biosynthesis, alongside broader dysregulation of lipid and xenobiotic metabolism networks, with these effects being reduced upon switching to a modified risk tobacco product or cessation [Lo Sasso et al. DOI: 10.3109/08958378.2016.1150368]. In male Kunming mice with alcohol and high-fat diet-induced liver injury, the IDI1 was significantly upregulated, and its expression was effectively inhibited by scoparone intervention, which alleviated the injury and modulated cholesterol synthesis pathways [Wei et al. DOI: 10.1016/J.Biopha.2022.113770].