Basic Information

Symbol
IFI44L
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Induced Protein 44 Like Interferon-Induced Protein 44-Like C1orf29 GS3686 TLDC5B Chromosome 1 Open Reading Frame 29
Location (GRCh38)
1:78619902-78646145
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006820.4
Sequence length
5829.0 nt
GC content
0.3774

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1566.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1682.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1425.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001375646.1 NCBI
CUUUCCUAGAGUCUCUGAAGCCACAGAUCUCUUAAGAACUUUCUGUCUC… 5857 nt 0.3780
NM_001375647.1 NCBI
CUUUCCUAGAGUCUCUGAAGCCACAGAUCUCUUAAGAACUUUCUGUCUC… 5341 nt 0.3814
NM_001375648.1 NCBI
CUUUCCUAGAGUCUCUGAAGCCACAGAUCUCUUAAGAACUUUCUGUCUC… 5096 nt 0.3785
NM_001375649.1 NCBI
CUUUCCUAGAGUCUCUGAAGCCACAGAUCUCUUAAGAACUUUCUGUCUC… 5145 nt 0.3782
NM_001375650.1 NCBI
CUUUCCUAGAGUCUCUGAAGCCACAGAUCUCUUAAGAACUUUCUGUCUC… 5369 nt 0.3820
NM_006820.4 NCBI
CUUUCCUAGAGUCUCUGAAGCCACAGAUCUCUUAAGAACUUUCUGUCUC… 5829 nt 0.3774
Summary

Predicted to be involved in immune response. Predicted to act upstream of or within cellular response to virus. Predicted to be located in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the IFI44L as a gene expression marker that is up-regulated in heart tissue from patients with various structural heart diseases compared to controls, with a mean fold change of 1.9858 and an adjusted p-value of 2.5184 × 10^-26, and it was part of a 62-gene signature that achieved approximately 95% classification accuracy [Fajarda et al. DOI:10.1186/s13040-020-00217-8]. In a separate study on human peripheral whole blood, the IFI44L was found to be down-regulated in patients with sepsis compared to healthy controls [Qin et al. DOI:10.1097/JCMA.0000000000000209].