Basic Information
Symbol
IFIT1B
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Induced Protein With Tetratricopeptide Repeats 1B
BA149I23.6
IFIT1L
Interferon-Induced Protein With Tetratricopeptide Repeats 1-Like Protein
Interferon-Induced Protein With Tetratricopeptide Repeats 1B
Protein IFIT1 Homolog B
Interferon-Induced Protein With Tetratricopeptide Repeats 1-Like
Location (GRCh38)
10:89378056-89385205
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
Cause of death analysis
MANE select
Transcript ID
NM_001010987.2
Sequence length
1972.0 nt
GC content
0.4270
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-551.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-591.93 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
421.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGAACUCUGUGGAUGAACCUUGAAGGAGCCUCCAAGCCUGAACCAAAGC… | 1972 nt | 0.4270 |
Summary
Predicted to enable RNA binding activity. Predicted to be involved in defense response to virus. Predicted to act upstream of or within cellular response to interferon-alpha; cellular response to interferon-beta; and response to bacterium. Predicted to be located in cytoplasm. Predicted to be active in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
A study in humans demonstrated that the IFIT1B mRNA is a body fluid-specific marker for venous blood identification, with its expression restricted to blood samples [Yu et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2025.103416]. In a separate human study, the IFIT1B was identified as a potential prognostic biomarker significantly associated with 28-day mortality in sepsis via Mendelian randomization analysis, though it was not selected for further mechanistic investigation [Li et al. DOI:10.1038/s41598-025-99619-z].