Basic Information

Symbol
IFNGR2
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Gamma Receptor 2 AF-1 IFNGT1 Interferon Gamma Transducer 1 IFN-Gamma Receptor 2 IFN-Gamma-R-Beta IFN-Gamma-R2 Interferon Gamma Receptor 2 (Interferon Gamma Transducer 1) Interferon Gamma Receptor Accessory Factor-1 Interferon Gamma Receptor Accessory Factor 1 Interferon Gamma Receptor Beta Chain Interferon Gamma Receptor Beta-Chain IFGR2 IMD28
Location (GRCh38)
21:33403369-33479348
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005534.4
Sequence length
1699.0 nt
GC content
0.5044

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-561.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -594.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 423.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.(((((((((((((....((((.....))))..(((.(((((((...((((((((.....(((((..((.((.((((....)))))).)))))))(((((((((.((.((.(((((.(((.(((...(((.....))).))).))).)))).).)).)).)))))).))).))))))))))))))).)))))))))......))))))).))).))..(((....)))....((((((..((((((((((...((((.(((.(((((...(((((((((((..(((.(((..((((.((((((..(((((..((((..(((.(((..........))).)))..))))..))))).(((((...((((((.(((((((.(((....))).))))........((((......))))...(((.((......)).)))..))).))))))....))))).......))).))).)))).))))))..))))...((((.(((((((.(((.(.(..((((......))))..).).))).)).(((..(((((...........)))))))).))))))))))))))))......))))).))).)))).((((((((......(((.(((((....(((.....((..........)).....))).....))))).)))......))))))))................((((......))))...((((((...((...((((((...((((((((((((((((.....((((((......))))))....((((.(((..((((.....(((((......)))))......((((((.(((((..(((((.(((..((((.........)))).))).)))))..)))))))))))((((((((((((((((((.((...........))))))).......((((((............))))))........)).))))))........)))))..((((..............)))).))))..)))))))))).))))).(((.((((.(((((..(((((((((..(((((((.((((((.....(((((....((((((((....(((.(((((((.......((((((...))))))..((((...))))(((((.((.((((((.......(((((.(((((((.....)))))))..))).)))))))).)))))))..(((.((((((((((((((..((((((((.(((.((....)))).)...))))))))..)))))))((.(((((((.....(((((((....(((((((((((((((..........)))))))..)))))).))..)))))))..))))))).)).............(((((......)))))...))))))).)))...)).))))))))....))))))))..........(((((((.(((((....)).))).))(((.....))).(((((......))))))))))..(((((((((......))))).))))))))))))))).))))..)))...)))).))))).))))).)))).)))...............))))))))))))))..))...)))))).(((((((((((...)))))))))))..)))))))).))..))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({((({((({((((((((({...({(({,..,))))..(((.(((((((...((((((({.,,,.(((((.,{(,((,(,((,,{{||||||||||}}||{,{{{({((.{{.||,|{|||.|||}|||}..((({{{..||,.,,}})))}))),.}.}}.})})))))).))),})))))))))))))),))))))))),...,,})}}}}},|||{||..(((((.((((...{{,.(({{.((((((.....)))).)).)))}.,}.))))))))),,|}||||,||}||,...}},||.||||{{{|{{,,,{{,..({({((({{{,.,{,..,,|.,,,..}}||{{|,|||{(((((...((((((.(((((((.(((....))}.))))........{({{......)))}||,(({.{{......)).)))..))).))))))....)))))..{{{{.,.....(.((((((.(((({,.((((..{((((.((({(((...((({,(((((............(((.((((({{((((((((((.........((.{((.{{,,{{(((((((((((((.{{{.{{{{{((....))}...((((((((......(((.(((((....(((.....{{..........|}.....))).....))))).)))......))))))))........||{{{{{{((((......))))...,,,,,,.{{(((.((((((((((.,{,.....((((((({....}))))))))..,,.))),,)).)))).))}..}||,,||},||{,,..,,{{||((({........))))))}}|,,,((((.(((..((((.........)))).))).))))|,.....,,,)))))).,,)))).)))..)))))))...))}})))))}))).,),,...))))))))))........}}..))))).))))))))))))..))),.))).))))})))).,}.......)))).))))))....,.,})))))).)))}}.{({.((((.(((((..(((((((((..(((((((.((((((.....(((((,.,,(({{{{((,,,.(({,(((({{{.......((((((...)))))).,((((...)))){((((.((.((((({,.....,{((((.(((((((.....)))))))..))).)))))))).))))))}..(((.((((((((((((((..((((((((,.((.((....))}).)...})))))))..)))))))((.(((((((..,,.,((((((,...{{(((((((((((((..........)))))))..)))))).}}..)))))))..))))))).)).............(((((......)))))..,))))))).)))...}}.}))))))),...}}}}}})),.....,,..(((({{{.{((((,,..|||,}}.}}|||.,,.,)))|{((((......))))))))))..,((((((((......))))),))})))))))))))).))))..)))...)))).))))).))))).)))).))}...........((((({,,{{{{.((((...})))}}}))))))}.}}},))))))))),}..{{{|||||||{|..,}))}.})}}}},,..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001329128.2 NCBI
CUUUUCAAAAUGGGGUUGACUGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAU… 2287 nt 0.5470
NM_005534.4 NCBI
GCUGCUCGGGAAGAGGCGGGCCCUGCGCGCCCUGCGCUCGCCAUGGCGG… 1699 nt 0.5044
Summary

This gene (IFNGR2) encodes the non-ligand-binding beta chain of the gamma interferon receptor. Human interferon-gamma receptor is a heterodimer of IFNGR1 and IFNGR2. Defects in IFNGR2 are a cause of mendelian susceptibility to mycobacterial disease (MSMD), also known as familial disseminated atypical mycobacterial infection. MSMD is a genetically heterogeneous disease with autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the IFNGR2 is an orthologous gene associated with inflammatory processes in radiation-induced lung injury [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357]. In human sepsis, single-cell RNA sequencing analysis found the IFNGR2 was expressed at higher levels in CHIT1+ neutrophils from non-survivors, where it functions as a pro-inflammatory receptor [Li et al. DOI:10.1038/s41598-025-99619-z].