Basic Information

Symbol
IFNLR1
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Lambda Receptor 1 CRF2/12 IL-28R1 IL28RA IFNLR Interleukin 28 Receptor, Alpha (Interferon, Lambda Receptor) Likely Interleukin Or Cytokine Receptor 2 Interleukin-28 Receptor Subunit Alpha Cytokine Receptor Class-II Member 12 Cytokine Receptor Family 2 Member 12 IL-28 Receptor Subunit Alpha IFN-Lambda Receptor 1 IFN-Lambda-R1 IL-28R-Alpha CRF2-12 IL-28RA LICR2 Class II Cytokine Receptor CRF2/12 Interleukin Or Cytokine Receptor 2 Interleukin 28 Receptor, Alpha Interferon, Lambda Receptor 1 Interleukin 28 Alpha Receptor Interleukin 28 Receptor A
Location (GRCh38)
1:24154168-24187959
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_170743.4
Sequence length
4566.0 nt
GC content
0.5456

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1741.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1824.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1201.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_170743.4 NCBI
GGGGACCUGGGCCCGGGCGGGGACGCCGCGGCAGGAAGGCCAUGGCGGG… 4566 nt 0.5456
NM_173064.3 NCBI
GGGGACCUGGGCCCGGGCGGGGACGCCGCGGCAGGAAGGCCAUGGCGGG… 4479 nt 0.5459
NM_173065.3 NCBI
GGGGACCUGGGCCCGGGCGGGGACGCCGCGGCAGGAAGGCCAUGGCGGG… 4435 nt 0.5445
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the class II cytokine receptor family. This protein forms a receptor complex with interleukine 10 receptor, beta (IL10RB). The receptor complex has been shown to interact with three closely related cytokines, including interleukin 28A (IL28A), interleukin 28B (IL28B), and interleukin 29 (IL29). The expression of all three cytokines can be induced by viral infection. The cells overexpressing this protein have been found to have enhanced responses to IL28A and IL29, but decreased response to IL28B. Three alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chlorpromazine (CPZ) administration induces dose- and time-dependent changes in cardiac gene expression, with the IFNLR1 showing a significant increase specifically at week 3 following repeated low-dose CPZ treatment [Tsai et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2011.04.006].