Basic Information

Symbol
IFRD1
RNA class
mRNA
Alias
Interferon Related Developmental Regulator 1 Interferon-Related Developmental Regulator 1 TIS7 PC4 Nerve Growth Factor-Inducible Protein PC4 12-O-Tetradecanoylphorbol-13-Acetate-Induced Sequence 7 Pheochromocytoma Cell-4 TPA Induced Sequence 7
Location (GRCh38)
7:112422887-112481017
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001550.4
Sequence length
3269.0 nt
GC content
0.4099

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-898.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -965.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1157.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001007245.3 NCBI
CUGGUUCAUUCAAGGUCUACAUAGUUAAAGGUUGUUCCAGAGGGAUGUG… 3480 nt 0.4086
NM_001197079.2 NCBI
UUUGAAUGCUCUCCAUGUUGAUGAAAUUCAUUCUUUAUCAAGAUGUAAA… 3400 nt 0.3944
NM_001197080.2 NCBI
CUGGUUCAUUCAAGGUCUACAUAGUUAAAGGUUGUUCCAGAGGGAUGUG… 3205 nt 0.3869
NM_001550.4 NCBI
GCCUUAGCUCCCGCGCUAGAGAGAAACAUGUAUCGUUUUCGAUCACAGC… 3269 nt 0.4099
Summary

This gene is an immediate early gene that encodes a protein related to interferon-gamma. This protein may function as a transcriptional co-activator/repressor that controls the growth and differentiation of specific cell types during embryonic development and tissue regeneration. Mutations in this gene are associated with sensory/motor neuropathy with ataxia. This gene may also be involved in modulating the pathogenesis of cystic fibrosis lung disease. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2010]

Forensic Context

A study in porcine skin demonstrated that the IFRD1 was significantly decreased in response to thermal exposure at 7 days post-injury [Price et al. DOI:10.080/15569520903097754]. A study in mice demonstrated that the IFRD1 mRNA increased within 24 hours post-traumatic brain injury in the cortex [Dash et al. DOI:10.23/B:NERE.0000023614.30084.eb].