Basic Information

Symbol
IFT22
RNA class
mRNA
Alias
Intraflagellar Transport 22 CFAP9 RABL5 FAP9 Intraflagellar Transport Protein 22 Homolog RAB, Member RAS Oncogene Family-Like 5 Rab-Like Protein 5 DKFZp761N0823 FLJ14117 FLJ13225 Intraflagellar Transport 22 Homolog (Chlamydomonas) RAB, Member Of RAS Oncogene Family-Like 5 Intraflagellar Transport 22 Homolog
Location (GRCh38)
7:101310914-101321823
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022777.4
Sequence length
4881.0 nt
GC content
0.4765

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1931.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2015.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 814.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130820.3 NCBI
GGGCCUCUCUCCGUCGCCAUGGAAACGAAAGCGGCCAAGUAGAGCUCCG… 4791 nt 0.4761
NM_001130821.3 NCBI
GGGCCUCUCUCCGUCGCCAUGGAAACGAAAGCGGCCAAGUAGAGCUCCG… 4912 nt 0.4758
NM_001130822.3 NCBI
GGGCCUCUCUCCGUCGCCAUGGAAACGAAAGCGGCCAAGUAGAGCUCCG… 4804 nt 0.4771
NM_001287525.2 NCBI
GGGCCUCUCUCCGUCGCCAUGGAAACGAAAGCGGCCAAGUAGAGCUCCG… 4954 nt 0.4786
NM_001287526.1 NCBI
GUCGGCCCUGCGGGCCUCUCUCCGUCGCCAUGGAAACGAAAGCGGCCAA… 2272 nt 0.4886
NM_022777.4 NCBI
GGGCCUCUCUCCGUCGCCAUGGAAACGAAAGCGGCCAAGUAGAGCUCCG… 4881 nt 0.4765
Summary

Predicted to enable GTPase activity. Predicted to be involved in intracellular protein transport. Part of intraciliary transport particle B. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that acute alcohol exposure during neurulation induces rapid transcriptomic changes in the rostroventral neural tube, with IFT22 being down-regulated (-0.25 Log2FC) 2 hours post-exposure, indicating its role in cilia-related processes and regulation of mitosis [Boschen et al. DOI:10.1016/J.Alcohol.2022.09.001].