Basic Information

Symbol
IGBP1
RNA class
mRNA
Alias
Immunoglobulin Binding Protein 1 IBP1 Protein Phosphatase 2/4/6 Regulatory Subunit Immunoglobulin (CD79A) Binding Protein 1 Renal Carcinoma Antigen NY-REN-16 Immunoglobulin-Binding Protein 1 CD79a-Binding Protein 1 Protein Alpha-4 BA351K23.1 (Immunoglobulin Binding Protein 1 (CD79A) ) Protein Phosphatase 2A, Regulatory Subunit Alpha-4 B Cell Signal Transduction Molecule Alpha 4 B-Cell Signal Transduction Molecule Alpha 4 Alpha 4 ALPHA-4 MRXS28 Alpha4 Α4 A4
Location (GRCh38)
X:70133345-70166324
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001551.3
Sequence length
1682.0 nt
GC content
0.4881

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-522.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -552.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 474.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001370192.1 NCBI
GCACUUCGCGCUCAAGCGACCGGAUCUUCAAACCGUGGGAGUGGUGCGG… 1507 nt 0.4857
NM_001370193.1 NCBI
GCACUUCGCGCUCAAGCGACCGGAUCUUCAAACCGUGGGAGUGGUGCGG… 1457 nt 0.4832
NM_001370194.1 NCBI
CUCUCUCCCCAAGAUGGCUGCUGAGGACGAGUUACAGCUGCCGCGGCUC… 1100 nt 0.4818
NM_001551.3 NCBI
GCACUUCGCGCUCAAGCGACCGGAUCUUCAAACCGUGGGAGUGGUGCGG… 1682 nt 0.4881
Summary

The proliferation and differentiation of B cells is dependent upon a B-cell antigen receptor (BCR) complex. Binding of antigens to specific B-cell receptors results in a tyrosine phosphorylation reaction through the BCR complex and leads to multiple signal transduction pathways. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.