Basic Information

Symbol
IGF2BP1
RNA class
mRNA
Alias
Insulin Like Growth Factor 2 MRNA Binding Protein 1 IMP-1 IMP1 Insulin-Like Growth Factor 2 MRNA-Binding Protein 1 Coding Region Determinant-Binding Protein IGF-II MRNA-Binding Protein 1 IGF2 MRNA-Binding Protein 1 Zipcode-Binding Protein 1 VICKZ Family Member 1 CRD-BP VICKZ1 CRDBP ZBP-1 ZBP1 Insulin-Like Growth Factor 2 MRNA Binding Protein 1 DeltaN CRDBP Insulin-Like Growth Factor 2 MRNA Binding Protein 1 IGF II MRNA Binding Protein 1
Location (GRCh38)
17:48997225-49056145
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006546.4
Sequence length
8796.0 nt
GC content
0.4907

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3065.77 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3219.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2177.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001160423.2 NCBI
CGCUCCAUUUUUUUUCAAGUCGAUUUUAUUUAGAGGCGGCGCCAGGGCG… 8379 nt 0.4862
NM_006546.4 NCBI
CGCUCCAUUUUUUUUCAAGUCGAUUUUAUUUAGAGGCGGCGCCAGGGCG… 8796 nt 0.4907
Summary

This gene encodes a member of the insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein family. The protein encoded by this gene contains four K homology domains and two RNA recognition motifs. It functions by binding to the mRNAs of certain genes, including insulin-like growth factor 2, beta-actin and beta-transducin repeat-containing protein, and regulating their translation. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2009]

Forensic Context

A study in human umbilical vein endothelial cells under high glucose conditions demonstrated that the IGF2BP1 stabilizes HMGB1 mRNA, promoting apoptosis [Zhang et al. DOI:10.7150/ijbs.114988]. A study in mice demonstrated that the IGF2BP1 is involved in the pro-inflammatory response during *E. coli*-induced sepsis, being upregulated in the late stage of lethal infection (H06) and as bacterial load reduced in the non-lethal model [Zhang et al. DOI:10.1093/jimmun/vkaf140].