Basic Information

Symbol
IGFBP7
RNA class
mRNA
Alias
Insulin Like Growth Factor Binding Protein 7 IGFBP-7 MAC25 PSF FSTL2 Insulin-Like Growth Factor-Binding Protein 7 Prostacyclin-Stimulating Factor Tumor-Derived Adhesion Factor PGI2-Stimulating Factor IGF-Binding Protein 7 IGFBP-RP1 IBP-7 TAF Insulin-Like Growth Factor Binding Protein 7 MAC25 Protein Angiomodulin IGFBP-7v IGFBPRP1 RAMSVPS AGM
Location (GRCh38)
4:57030766-57110690
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001553.3
Sequence length
1427.0 nt
GC content
0.5214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-521.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -546.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 333.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001253835.2 NCBI
ACUCGCGCCCUUGCCGCUGCCACCGCACCCCGCCAUGGAGCGGCCGUCG… 1030 nt 0.5981
NM_001553.3 NCBI
ACUCGCGCCCUUGCCGCUGCCACCGCACCCCGCCAUGGAGCGGCCGUCG… 1427 nt 0.5214
Summary

This gene encodes a member of the insulin-like growth factor (IGF)-binding protein (IGFBP) family. IGFBPs bind IGFs with high affinity, and regulate IGF availability in body fluids and tissues and modulate IGF binding to its receptors. This protein binds IGF-I and IGF-II with relatively low affinity, and belongs to a subfamily of low-affinity IGFBPs. It also stimulates prostacyclin production and cell adhesion. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene, and one variant has been associated with retinal arterial macroaneurysm (PMID:21835307). [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in human primary lung microvascular endothelial cells demonstrated that acute X-ray irradiation (10 Gy) induced a significant transcriptional response, with the IGFBP7 mRNA upregulated 1.7-fold at 24 hours post-irradiation as part of a broader senescence regulatory program identified via RNA-seq [Bouten et al. DOI:10.1038/s41598-021-03636-7]. This was accompanied by extensive gene expression changes leading to cell cycle arrest, DNA damage response, pro-inflammatory signaling, and endothelial-to-mesenchymal transition, with senescence confirmed in 80-85% of cells.