Basic Information

Symbol
IGFN1
RNA class
mRNA
Alias
Immunoglobulin Like And Fibronectin Type III Domain Containing 1 EEF1A2BP1 Immunoglobulin-Like And Fibronectin Type III Domain-Containing Protein 1 EEF1A2-Binding Protein 1 KY-Interacting Protein 1 DKFZp434B1231 EEF1A2 Binding Protein KYIP1
Location (GRCh38)
1:201190824-201228952
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001164586.2
Sequence length
11811.0 nt
GC content
0.5679

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4628.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4827.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2742.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164586.2 NCBI
AGUCAAUCCAGAGCCUCAGCAAGCAGCAGCUGGAAACGGGGAAGAGGGA… 11811 nt 0.5679
NM_001367841.1 NCBI
AGUCAAUCCAGAGCCUCAGCAAGCAGCAGCUGGAAACGGGGAAGAGGGA… 4440 nt 0.6014
Summary

Predicted to act upstream of or within myoblast differentiation and myoblast fusion. Predicted to be located in Z disc and nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in pigs demonstrated that the IGFN1 was uniquely upregulated in the biceps femoris and longissimus dorsi muscle of cold-exposed Bama pigs, indicating its association with an immune or inflammatory transcriptional response in this cold-sensitive breed [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431].