Basic Information

Symbol
IGSF10
RNA class
mRNA
Alias
Immunoglobulin Superfamily Member 10 CMF608 Calvaria Mechanical Force Protein 608 FLJ25972 Immunoglobulin Superfamily, Member 10 IgSF10
Location (GRCh38)
3:151425384-151461186
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_178822.5
Sequence length
8562.0 nt
GC content
0.4400

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2316.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2470.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2107.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((.....(((((((((.((((((..((.........))))))).).))))......(((((((......))))))))))))..((((..(((...)))))))....(((..((((........))))...))))))))).((((((.((....(((..(((.......)))..)))....)).))))))((((((((((.((((....(((((((((...(((........))).)))))))))...))))((((.(((.(((....))).))).))))((((.((....(((((((.(((.((((...((.((((((((((((..((.((.((((.((.((((((((.((((.(((....(((((((((((((....(((((((((((...............)))))))))))......((((((((((((.........(((((((...(((((((....))).)))).............((((.((((.(((.(........).))).)))))))).........((((((((((.(((((...................))))))))))).))))((((((((...(((.(((((..((........((..(((((((((((((((....)))...))))))))))))..)).....))..))))).)))..((........))...)))))))).(((.((((....((((((((((.(((.((((((...........(((((.((((...((((((((.((((.((((.(((((...((((...(((......)))..))))..........(((.((.(.(((((....((((.(((((....)))))(((((((((((((((((.....(((((.(((..(((....))).))))))))..((((......)))).......(((((((((...(((.(.(((((((........)))).))).).))))))))))))..((((.(((((.....))))).(((((((.((((.(((((((((.(((........)))....(((((((((((((.(((((..(((((..(((.....))))))))..)))))......(((.....((((((((((..((((.((((.......(((((((((..(((((((((.(((........))))).)))))))..)))))))))))))...))))..........(((((..(((((((((((((((...................))))))))......))))))))))))....((((((.((.(((...((((((.((.....)).)))))).))))).))))))((((((((.........((((((((((((.((((((......)))................))).))))))))))))..((((......................)))).(((((......))))).((((((((...((((((..........))))))((((((................))))))....(((.......)))....((((((......))))))..)))))))))))))..))))))).))))))......)))...))))))).)))))).....(((((((.(((......))).)))))))(((((..((.((((((((.......)))))))).).)...))))).))))).))))..))))..)))))))((((((..(((((.....(((((.((((....(((((......)))))....)))).))).)).......(((.((((.....((((((((((((((.(((((((.(((((((((....))))......))))))))).....((((.(((.((((.....)))))))))))...)))))))))).))))))).....)))).))).((((.((((....))))))))..)))))...))))))))))........((((((...))))))........(((((....))))).......(((.((((...........)))))))(((....)))....)))))))..........))))))))))..............)))).......))))).)))))).((((((.....))))))...............))))))))).))))))).((((........))))))))))))).)))))..(((((((((.(((((((...)))))))))))....((((........))))...((((((.((......)).))))))))))).)))))).((((((((.....)).))))))))).))...))))))))....))))))).......))))))).(((((.((...........)).)))))..((((((....((((....))))))))))..))))))))))))...)))))...))))))))..)))))))....(((..........)))..((.......))..............(((....)))....((((((((..((.((((((......((((((((.....((((((((((((((......))).....)))))))))..((((....))))(((((...(((...(((((((((....(((((..(((((((((((((......))))((((((((........((((...)))).....((((((.(.......).)))))).........................((((........)))).(((((.((((....((((...((((....................))))....(((........))).........................(((((((((((....((((((...((((...))))..)))))).))).))))))))((((........))))...))))......)))).))))))))))))).......(((......)))....((((....))))....................)))))))))......(((.((.(((....))))).)))...(((((((((((........)))..)))))))).((((.((((((((..(((((...((.(((((((.(((..(((.(..((((((..((((.(.((((((.(((((((((((((.((.......(((((.........))))).......))..))))(((.((((((((((((.((((((((((.((...)).))))...((((((....)))))).(((((.(((((((..(((((((((((.....((((...))))..)))))))..((((((...((.......))...))))))..))))....))))))).)))))((((...)))).(((........)))..(((((((((..........))))))))).......))))))))).(((.......)))...(((((.((((.((((.(((((..((((((((((((((((...(((((..((((...((((((((..(((((((.....................((((((....)))))).((((.((((((......(((.(((...........))).)))...(((((....))))).....((((((..(((((((((((........(.(((..(((((((..((((..............((((((......))))))))))))))))).))))(((((...((((.(((...))).))))....))))).......(((....)))))))).....((((((((......((.((((((....))..).))).)).......)))))))).))))))....(((.(((((((((...............(((((.(((((.....(((((...))))).((((..(((((((.(((((((.....)))))))..((((.....((((....((((..((.(((((.(((.........................(((((...))))).....(((((......)))))...............((((((....(((((...((......))..)))))...)))))).........((.....))....(((((.....((((((...(((..((..((((((((..(((((....(((...(((....)))....................((((((((((..(((...((((..(((((((........................))))))).))))................)))...))))))))))................((((.((((((((((((((((((((((.(((.((((...((((.........))))...(((((.((((.((.(((...(((.(((....))))))..))).)))))).)))))..(((.((....)).)))..(((((........((((....)))))))))....((((((...............))))))...((((((.((((.((...(((((((..(((((..((......))..)))))..(((((((((((((((((((.........((..(((((.(((.(((((((((..(((((.......)))))..)))((......)).............((((((((...(((((..(((.(((...((.....(((..((((.(.((........)).).))))))).....))...)))))).........((((........)))).........((((.((((.(((((((((..(((............(((((((((.((...((((((................)))))).........(((........))).(((((((.....((....((((......))))....))......))))))))).))..))))))).......(((((.....)))))........)))..))))))))).))))..))))............((((((((........(((((((....((((......)))).....((((..(((..(((.....))).))).((((((((((((((((..((.((((((((((.((((((...)))))).))..)))))))).......(((((..((((((((.((((((((.((......((((((..((..((.(((((...((((((.....))))))......)))))))))..........((((((((((((......))..))).)))))))((((((...)))))).......(((..(((((((.......)).))))).)))..(((((((.((((.(((.........))).......((((((((((.(((.(((((((....)))).)))..))).....))))))))))(((((((((.(.....).))))).)))))))).))))))).))))))......)).)))))).....((((((.((((.(......)))))...)))))).)).)))))))).))))).((((.(((...((..(((.((...)).)))..))...))).))))........))..))))))).)))))))))(((((.(......).)))))))))......))))))).......))))))))))))))))).))))...))).))).))))))))..))........)))).))))))))..((((...)))).....)))))))...(((....)))..((((((......))))))....)))))))))((((.((((....)))).)))).......)))).))))))((((((...((((......))))...))))))......((((((......))))))..........(((((((((((.(((((........)))))...).)))))))))).......))))))).))))).....(((((((((....(((.(((((.......))).)).)))..)))))))))...........((((.....)))).((((((((((((..(((((((.......))).))))..........(((((((((((...((((.....((((((((((.(((((((............)))))))........((.(((((((.((((...(((((....))))).(((((.....)))))..................)))).))))))).)).))).))))...))).....)))).....)))))))).))).............((((.((((...((((((...))))))))))..)))).........)))))))))))).)))))))))..))).))))).)))))))...))))).......(((...)))....))))))))..))....))).)))))).........(((((....))))).................))))))))))))))).)))))))).....))))....(((((......)).))).....))))))))))).........(((((.....)))))(((.((......))..)))......................))))).)))))))))))))).)))...)))))))))))).)))).....((((((((...))))))))..(((((..(((((....((......))..)))))..)))))....)))).)))...)))))..)))....))))...)))))...))...))))))))...((((((..((((..(((.(........).)))...))))....))))))..))))))))))).))))......(((((....)))))(((((......)))))..((((.(((.(((....))).)))))))............(((((....))))))))).)))))....((....)).(((...(((......))))))...)))))))))...)))((((..((((((.............))))))...))))....))))))))).)))))).).))))...((((..((....))..))))))))))..))))..))).)))))).).)))))))))))))...)).)))).)))))....))))).))))..)))..)))))...((((((....(((((....((((((.(..(((..(((((((.((((......)))).((((...(((........)))...))))...)))))))..)))..))))).))..))))).)))))).......((((((((...)))))))).((.((((((......)))))).))..........((((((.(((((............(((((..((((((((((..((((((.(((....)))))))))..))....((((((.....))))))))))))))....))))).(((((...((..(((((((((((.((...........)).))))).))))))..))...))))).(((((.........))).)).(((((....(((((((((((.......((((......)))).......)))))))))))..)))))((((.(((((.....((((....))))))))).)))).........)))))((((((((..((((((.......))))))(((((((...)))))))..))).)))))..))))))(((........)))(((.....)))))....))))))))((((.((.(((......))))).)))).((((.(((((....))))))))).........)))))).))..))))))))..(((((((..((.....))..)))))))....)))))))).))..............((((((..(((((((((((((((...........)))))))((((((((...(((...(((.......((((....))))....))).)))..))))))))......(((..((.(((((((....(((...........))).....))))))).))..))).((((......)))).(((...))).((((((((..........))))))))(((.......)))..(((((..((((((((((((..(((((((((((((..(((((......)))))....)))))))))..........................))))...))))))))))))..........((((........)))).....))))).............))))))))..))))))(((...((((.........)))).)))...)))))).))..))))))..))))))))...)))).))).)))))))....)).))))................(((((.((((.((.....)))))).))))).)))))))).)).......(((((((((((.((((....))))...))))).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{{{((({...,..((({(((((.((((((..((.........)}))))).},)}})|..,,,(((((((......))))))),}}))..((((..{((...))}))))...,(((,.{(((,,.,,,,,|||}...}}}})))))}||{{{|||||..||||..{{{......}))),,}))....)),.)))).{{((((((((.((((....(((((((((...(((........))).)))))))))...))))((((.(((.(((....})).))).)))){{{{,||....(((((((.(((.((((...{{.((((((((((((...,.,..((((.((,,{{{{{,({(({{{(((....(((((((((((((....(((((((((({....,....,.,||,})))))))))),...,,(({{{{||{{({..,,,,...(((((((...,{{((((....})),.})}.,...........((((.((((.(((.(........).))).)))))))).........((((((((((.(((((,.,,....,,,.,...,..}))))))))))}})))((((((((...(((.(((((..((........,,..(((((((((((((((....))),..,)))))))))))..},....,))..))))).))){.,{........}},..)))))))).(((.((((....((((((((((.(((.((((((,,,........||{({,{(((,{.(((((,,{.((((.((((.{((((...(((({,.(((.....,)|)..))))........{,{((.((.(.(((((....{(((.(((((....)))))(((((((((((((((((...,{{(({{{((({.{{({{{{|||.|||||||,..((((......)))).......(((((((((...(((.(.(((((((........)))).))).).))))))))))))..(({{,(({((..,,,}}}}}.,{((({|.{{{|.(((((((((,({(,,,,...,|||....(((((((((((((.{((((..(((((..(((.....))))))))..))))},,....{,{,,..{((((((((((..((((.((((.......(((((((((..((((((({{.(((........)))}}.)))))))..)))))))))))))...))))..........{((((,.((((({{((((((((...................))))))))......||||||||}||,....(((({{.((,(((...{{{{{|,||,,,..}}.)))}}}.)))}},})}}}}||.,{{{{...,,}},.((((((((((((.(({(((......}}}.......,........))}.))))))))))))..|||{,,,.........,.,,....{{|||,.(((((......)))))}||||||||...((((((..........))))))|{|{,,..,...,|........,}}|||{{............))}}}..{(((((......))))))..,}},,)))})))),})}})})},))))}).}...})).,,.))))))),,))))).....(((((((,{({......))).)))))))(((((..((.((((((((.......)))))))).).}...))))).))))).))))..)))).,}}))))|((((((..(((((....,({(((.((((..,.(((((......))))).,,.)))).))).)).....,,(({.{(((.....((((((((((((((.(((({((.(((((((((....))))......))))})))),,...{(((.(((.((((.....))))))))))),,,}))))))))),})))))).....)))).))).((((.((((....))))))))..)))))...)))))))}}},}}},.}}||||||}}}))}))).}}.,,..(((({....})))).......{{(,((((...........})))))},,,...,})}....,})))))..........)))))))))).........,....}))).......))))).})))))}((((((.....)))))).......,.......})))})))).))))}},.{(((......,.)))))))))}))),)))))..((({(((((.(((((((...))))))))))),...((((........))))...((((((.((......)).))))))))))).}))))).{(((({{(.....}}.))))))))).))}..})))))))....))))))).......}||||}}.(((((.((...........)).)))))..{(((((....((((....}))))))))),.)))}))))))))}..))}}.,})))))))))..))))))).},.{{{..........|||.{({......,)),.............(((....)))....((((((((..((.((((((......((((((((.......((((((((((((......))}.....))))))))}..(((({{.{||,,{{{{{...{{{...(((((((((....(((({,((,((((((.((((......))))((((((((.,{,,...{{{,...}|||{,,{{(,,..,.,..,}}|{(({..,,)}}}............,{..,.....,|{|........,}||{{{{{{,{.,.......,,,}}||||,...................,,}},...(((........))).....................,,,,(((((((({{(,,.,((((((...((({...})))..)))}}}.|)).))))))))|||,|,......})))..})))),,.....,..,}})).))))))))......{((({{{..{{,,....((((....))))......,,..,{{,,,....}}||.,}}...........,,.|||....)))))})||.,,(((((((((((........)))..))))))))..|||.||((((({{.{((((...((.(((((((.(((..(((.(..((((((..((((.{.((((((.(((((((((((((.((.......(((((.........))))).......))..))))(((.((((((((((((.((((((((((.{,...,}.))))...((((((....)))))).(((((.(((((((..(((((((((((...,,{{{{...})))..))))))}..((((((...((.......))...))))))..})))....))))))).))))).,,...{||||.(((........)))..{((((((((..........)))))))))}}}....))))))))),(((.......))).,.(((((.((((.((((.(((((..(((((((((((((({(...(((((..((((...((((((((,,(({{,{{.....................{((({{,,..|}}}}}{((((.{((((((.,...((({((,.....({{{{{||,.......(((((....))))).....,,......{{,{{(....))),,...}}}||}}}{{|||||,.,(({.{{.....}}.,}}((((((......)))))).,,.||||||,.,,,..}|||}}}.{{{.{{,...})).}}|{((((((((({.....{((,....,,)))..,...})))))))))},...........,.....)}{{(.(({((({,..,,{.....}}}.{{({......|}|}{((((((((...,{{{,.......((((({((((({.{,.(((((...))))).((((,.(((((((.(((((((.....)))))))..((((.....((((....((((..((.(((((.,{{.........................{((((,,,||||,.....(((((......)))))...............((((((....(((({...{{......}}..}))))...)))))}.........{{.....||.......||.....((((((.,,(({.,((,.((((((((..,,.,{..........{((,.,.||}.,.,................((((((((((..(({...({{(..{,((({{,,........,,..,,,,,.,,,,,}}})))}))}}...........,,...})}...))))))))))..........,...,.((((.((((((((((((((((({{{{{.{{{.{{{{...{{{{.........))))}.,((((,.(((,,((.(((,...,,.,{|,...}}},,,.,))).)))))).}))))}.,{{.((....)).,||,,{(,,..,,|,..(((((,..,|||||||{{{{..,,(((({...||,,.......,,||||.,,(({{((.(((,.,,...(((((({..(((({..,,......,,..}))))..(({{((({{({{{{{((((.,,......{{..{(({,{{{,.{{{{||||{..{{{{{,,.....))))}..}}|((......))),,...,,,....,,,(((((..,((((({.(,,,{,{,..(({,...{((|..,{{.,.||,.,,,||,}|,,.}}}}}},.,,{{{{{{,.|{||,..,,...{{(((....{,{{,,||||||{{{,..((({.{{{{.{(({{((((,,((,............((((({{.,.,(,,,(((({,.,,,,{{.........,},,||,,,....,,((({,......}},.,{{((({.....{{....((((......))))....||,.....)))}}}|||.,|,.,}}}})),,,,...(((((.....)))))........}}}..|})}|)))}.||||,,||||,...,,,,,..{{({(({(({{....,.{,,{{{{,...((((......)))),,,,.}|||,.{||,,|{{,,,,,))),)}}.{{{{{||||{{{{|||},||.{((((((({,.{(((((...}))))}.},.,)))))))}....,,.{{{{{..{{{{{|||,|||||||||{(......,(((((,,({,,{{.{|||,.,,((((((.....)))))},.....|||.|||||,....,....((((((((((((.....,},..})).}}}}}}|((((((...))))))}....,.||{..(((((((.......))}})))).}}}.,((({(((,({((,((({{{...{,.,......}}.{{|||||||{...,.(((((((....)))).)))..}}.,,,,,,))))|||||(((,,,,{{,|....,)})))}}.)},|}))}.}})))}}.}}||||,...,,)}|))}}|,.||||{({{((,((,,.{......}))},...}}}}}}.}}.)))))))).))))}.({(({((({{{((.,({{.{,...,).)))..)).,,,}}.,|||,,,,.||{||..||}}}}}.}}}}}}}}|(((((.(......).))))))}},......))))))),,,,}}),})))))))))))})}})}))},,}))).))),))}))}))..))....,.,,))}).)))))))}..{(({,..,}))}}.,,)))))))...{((....)))..{(((((......)))))),,},)}})))||.((((.((((....)))).))))....,..}}}).)))))|{(((({...{{{|,,,,,,))))...}))))}......((((((......)))))).....||,,.(((((((((({.(((((........)))))...}.))))))))))...,,.,}},,|||,|||||,...,(((((((((....(((.(({{(,......))}.)).)))..))))))))).,....,,,,.{{{{..,,,))}},|{{((((({{{{..,{|||||.......})).}}}}.,,.,,,...((((((({,{{,}.{|||,...,,||||||||,.(((((((............))))))),,}},,,,{|,|{{{|||,||||...||{{|,,,,)}))),{||||,..},))),}...,....}}}}},,},.}})).})))))),),,}},.))))...,}}},...}))).....)))))))),,}},},.}}}}}}.,,||||}||||}..{{((({...})))))}}}.,,}))}...,}}},.))))}}}})))),))))))))},,})).))))).))))|||...|{|,.,,.....{((...}}}.,..)))))))),,))..,}))).))))))......,,.,,,,,....,))||,,,,.....,,.,,.,,))))))))))))))).)))))))).....))))....(((((......)).))).....))))))))))).........(((((.....))))),,,...}}.}}}))}}),|,..............}}},....,,},.)))),)))))))))})))))))))),)))))))})))).....{(((((({...})))))))|.(((((..(((((....((......))..)))))..)))))....}))).}})...)))))..)))....))))...)))))...))...))))))))}..((((((..((((..(((.,........}.))).,.))))....))))))..,)))))))))).))))......(((((....}))))(((((......))))).,{({|.{{|.(((....))).}}}}}}}............({{((....))))))))).)))))....||..,,}..{|{,,|{{{....,,)))}},...,))))))))...)))((((..{(((({.............}))))}...))))....))))))))).)))))).}.))))...((((..((....))..))))))))))..,)))..))).)))))).).)))))))))))))..}))))).)))))))....))))).))))..}}}..}}}}}...,{{{{,....{{{((,,,.(((((({(..(((..(((((((.((((......)))).,{,{{.{(((.....},}),}..........)))))))..)))..))))).)).,))))}.,}})))}},....((((((((...)))))))).{{.{(((((......)))))).))........{{((((((.,(({{{......||.}}(((((,.(((((({{{{..((((((.{((....}}}))))))..}}...{((((((.....)))))))})))))}.,,.))))).{((((...{{..(((((((((((,((....,,,.,,,)),}}}}).))))))..,}...))))}.{((({.........})).||.(((((....(((((((((((......,((((......)))).......)))))))))))..)))))(((|.(((((.....((((....))))))))).|)))........,}})},{(((((({..{(((((.......)))))}(((((((...)))))))..})).)))))..)))}}}|}}....,.,,|,.(((.....))),.,)),))))))))((((.((.(((......))))).)))).((({,(((((....))))))))).........)))))).))..))))))))..(((((((..((.....))..))))))).....||}||||{{|....,}}})}..,,{{(|{{..{{((({{{(((((((...........)))))))((((((((...(((...(((....,..({{{.,,.}))).}}.))).)))..))))))))......,{({{({.,{,,,,,....|||}....,..,|||}|{{,,.}}}}})},))..}}|.({{{.......,||,(((...))).{(({{{((,{{,,..||,|}}}}}}}|||,,,,,,}}},..{{{{{..((((((((((((..(((,(({{(((({.{(((((......))))}...||||||}}}}.}}},}}............,,......}))}..))))))))))))..........{{{{........}))).....))))}.............}))))))}..))))}){{{...||||.........)))).}}},..,,}))).))},})))))..))))))}}...)))).))).)))))))....}}.}))),,.....,.....,..{((((.(((,,((.....)))))).))))).)))))))).)}.......(((((((((((,((((....)))).,.))))).))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178145.3 NCBI
AAGAAUCCUGAUGCCCAAGCCAUGCUGCACACAUAUUAAGUCAAAUUCU… 2601 nt 0.4022
NM_001178146.3 NCBI
AAGAAUCCUGAUGCCCAAGCCAUGCUGCACACAUAUUAAGUCAAAUUCU… 2448 nt 0.4036
NM_001385060.1 NCBI
AAGAGCGGCUAUGCGAAAGUUCACGUCUGCAUCUGGUCUUCUCUCGGGU… 8610 nt 0.4375
NM_001385061.1 NCBI
AAGAGCGGCUAUGCGAAAGUUCACGUCUGCAUCUGGUCUUCUCUCGGGU… 8523 nt 0.4374
NM_001385062.1 NCBI
AAGAGCGGCUAUGCGAAAGUUCACGUCUGCAUCUGGUCUUCUCUCGGGU… 8710 nt 0.4406
NM_001385063.1 NCBI
AAGAGCGGCUAUGCGAAAGUUCACGUCUGCAUCUGGUCUUCUCUCGGGU… 8729 nt 0.4407
NM_178822.5 NCBI
CUUCCUUCCCUCCCAGAGCUCCGGACCAGCUCCGCACGACCCCAGCAGC… 8562 nt 0.4400
Summary

Predicted to be involved in regulation of neuron migration. Predicted to act upstream of or within ossification. Located in extracellular region. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human postmortem dorsolateral prefrontal cortex demonstrated that the IGSF10 exhibits a complex expression pattern in major depressive disorder and suicide [Pantazatos et al. DOI:10.1038/mp.2016.130].