Basic Information

Symbol
IGSF11
RNA class
mRNA
Alias
Immunoglobulin Superfamily Member 11 VSIG3 BT-IgSF Igsf13 CT119 Brain And Testis-Specific Immunoglobulin Superfamily Protein V-Set And Immunoglobulin Domain-Containing Protein 3 Cancer/Testis Antigen 119 MGC35227 CXADRL1 BTIGSF Brain And Testis-Specific Immunoglobin Superfamily Protein V-Set And Immunoglobulin Domain Containing 3 Immunoglobulin Superfamily, Member 11 CXADR Like 1 Bt-IGSF IgSF11
Location (GRCh38)
3:118900557-119146068
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001015887.3
Sequence length
3523.0 nt
GC content
0.4462

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1077.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1141.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1064.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001015887.3 NCBI
AGUCCUGGGGCAGGGCUGGGUGGCACGGCUGGCGAGCCCGGAACGCCUC… 3523 nt 0.4462
NM_001353318.2 NCBI
AGUCCUGGGGCAGGGCUGGGUGGCACGGCUGGCGAGCCCGGAACGCCUC… 3673 nt 0.4500
NM_001353319.2 NCBI
AGUCCUGGGGCAGGGCUGGGUGGCACGGCUGGCGAGCCCGGAACGCCUC… 3589 nt 0.4505
NM_001353320.2 NCBI
AGUCAGCUGACCCUGCAGUGUGCAGGCGAGCGCAGGGAGUACGCCAUGU… 3477 nt 0.4305
NM_001353321.2 NCBI
AGUCCUGGGGCAGGGCUGGGUGGCACGGCUGGCGAGCCCGGAACGCCUC… 3451 nt 0.4457
NM_001353322.2 NCBI
AGUCAGCUGACCCUGCAGUGUGCAGGCGAGCGCAGGGAGUACGCCAUGU… 3534 nt 0.4318
NM_001353323.2 NCBI
AGUCCUGGGGCAGGGCUGGGUGGCACGGCUGGCGAGCCCGGAACGCCUC… 3439 nt 0.4466
NM_001353324.2 NCBI
AGUCCUGGGGCAGGGCUGGGUGGCACGGCUGGCGAGCCCGGAACGCCUC… 3367 nt 0.4461
NM_001353325.2 NCBI
AGUCCUGGGGCAGGGCUGGGUGGCACGGCUGGCGAGCCCGGAACGCCUC… 3613 nt 0.4448
NM_001353326.2 NCBI
AGUCCUGGGGCAGGGCUGGGUGGCACGGCUGGCGAGCCCGGAACGCCUC… 3541 nt 0.4442
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

IGSF11 is an immunoglobulin (Ig) superfamily member that is preferentially expressed in brain and testis. It shares significant homology with coxsackievirus and adenovirus receptor (CXADR; MIM 602621) and endothelial cell-selective adhesion molecule (ESAM).[supplied by OMIM, Apr 2005]

Forensic Context

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