Basic Information

Symbol
IGSF11
RNA class
mRNA
Alias
Immunoglobulin Superfamily Member 11 VSIG3 BT-IgSF Igsf13 CT119 Brain And Testis-Specific Immunoglobulin Superfamily Protein V-Set And Immunoglobulin Domain-Containing Protein 3 Cancer/Testis Antigen 119 MGC35227 CXADRL1 BTIGSF Brain And Testis-Specific Immunoglobin Superfamily Protein V-Set And Immunoglobulin Domain Containing 3 Immunoglobulin Superfamily, Member 11 CXADR Like 1 Bt-IGSF IgSF11
Location (GRCh38)
3:118900557-119146068
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001015887.3
Sequence length
3523.0 nt
GC content
0.4462

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1077.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1141.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1064.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_152538.4 NCBI
AGUCAGCUGACCCUGCAGUGUGCAGGCGAGCGCAGGGAGUACGCCAUGU… 3606 nt 0.4326
Showing 11 to 11 of 11 entries
Summary

IGSF11 is an immunoglobulin (Ig) superfamily member that is preferentially expressed in brain and testis. It shares significant homology with coxsackievirus and adenovirus receptor (CXADR; MIM 602621) and endothelial cell-selective adhesion molecule (ESAM).[supplied by OMIM, Apr 2005]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.