Basic Information
Symbol
IGSF21
RNA class
mRNA
Alias
Immunoglobin Superfamily Member 21
Immunoglobulin Superfamily Member 21
RP11-121A23.1
MGC15730
Immunoglobin Superfamily, Member 21
IgSF21
Location (GRCh38)
1:18107710-18378483
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
MANE select
Transcript ID
NM_032880.5
Sequence length
1892.0 nt
GC content
0.6305
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-749.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-780.65 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
477.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GAUUCGGCUCCAAACUCCGGCGCUGCAGCCGAUCGGACUCUGGGCCGCG… | 1892 nt | 0.6305 |
Summary
This gene encodes a protein which has two immunoglobulin (Ig) domains and is a member of the immunoglobulin superfamily. Proteins in this superfamily are usually found on or in cell membranes and act as receptors in immune response pathways. [provided by RefSeq, Sep 2011]
Forensic Context
A study in rhesus macaques demonstrated that chronic ethanol self-administration broadly altered the brain transcriptome, identifying the IGSF21 as a key hub gene positively correlated with ethanol intake within the central nucleus of the amygdala coexpression network [Iancu et al. DOI:10.1111/Adb.12501]. Cross-species molecular analyses confirmed the IGSF21 as a conserved network hub correlated with ethanol consumption in macaque transcriptome studies [Farris et al. DOI:10.1016/J.Alcohol.2017.11.036].