Basic Information

Symbol
IHH
RNA class
mRNA
Alias
Indian Hedgehog Signaling Molecule HHG2 BDA1 Indian Hedgehog Protein Indian Hedgehog (Drosophila) Homolog Indian Hedgehog Homolog EC 3.1.-.- HHG-2
Location (GRCh38)
2:219054424-219060921
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002181.4
Sequence length
2473.0 nt
GC content
0.6603

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1146.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1180.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 729.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002181.4 NCBI
ACUCGGCCCCGGGCUGCGCCGCAGACGGCAGCAGCUCCCGCUCCGCCCG… 2473 nt 0.6603
Summary

This gene encodes a member of the hedgehog family of proteins. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate multiple protein products, including an N-terminal fragment that is involved in signaling. Hedgehog family proteins are essential secreted signaling molecules that regulate a variety of developmental processes including growth, patterning and morphogenesis. The protein encoded by this gene specifically plays a role in bone growth and differentiation. Mutations in this gene are the cause of brachydactyly type A1, which is characterized by shortening or malformation of the fingers and toes. Mutations in this gene are also the cause of acrocapitofemoral dysplasia. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.