Basic Information

Symbol
IKBKB
RNA class
mRNA
Alias
Inhibitor Of Nuclear Factor Kappa B Kinase Subunit Beta IKK-Beta NFKBIKB IKK2 IKKB Inhibitor Of Kappa Light Polypeptide Gene Enhancer In B-Cells, Kinase Beta Inhibitor Of Nuclear Factor Kappa-B Kinase Subunit Beta Nuclear Factor NF-Kappa-B Inhibitor Kinase Beta Serine/Threonine Protein Kinase IKBKB I-Kappa-B-Kinase Beta I-Kappa-B Kinase 2 EC 2.7.11.10 IKK-2 Nuclear Factor Kappa B Kinase Subunit Beta EC 2.7.11.1 EC 2.7.11 IMD15A IMD15B IMD15 IKK-B IkBKB
Location (GRCh38)
8:42271302-42332460
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001556.3
Sequence length
3938.0 nt
GC content
0.5246

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1370.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1441.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1299.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001190720.3 NCBI
GUGACGUCAGAGCAGGAAGUGUUUGAGGAAGUCGCGCCGCGCUGCCCGC… 3805 nt 0.5246
NM_001242778.2 NCBI
GUGACGUCAGAGCAGGAAGUGUUUGAGGAAGUCGCGCCGCGCUGCCCGC… 3843 nt 0.5228
NM_001556.3 NCBI
GUGACGUCAGAGCAGGAAGUGUUUGAGGAAGUCGCGCCGCGCUGCCCGC… 3938 nt 0.5246
Summary

The protein encoded by this gene phosphorylates the inhibitor in the inhibitor/NF-kappa-B complex, causing dissociation of the inhibitor and activation of NF-kappa-B. The encoded protein itself is found in a complex of proteins. Several transcript variants, some protein-coding and some not, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the IKBKB was expressed higher in monocyte-derived macrophages compared to microglia after spinal cord injury [Stewart et al. DOI:10.1186/s12974-021-02161-8], while a study in rats found its expression was significantly altered in liver signaling pathways on day 1 following burn injury [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].