Basic Information

Symbol
IKBKE
RNA class
mRNA
Alias
Inhibitor Of Nuclear Factor Kappa B Kinase Subunit Epsilon IKK-I IKKE KIAA0151 Inhibitor Of Kappa Light Polypeptide Gene Enhancer In B-Cells, Kinase Epsilon Inhibitor Of Nuclear Factor Kappa-B Kinase Subunit Epsilon Inducible I Kappa-B Kinase I-Kappa-B Kinase Epsilon IKK-Epsilon IKK-E IKKI IKK-Related Kinase Epsilon Inducible IkappaB Kinase EC 2.7.11.10 EC 2.7.11 IkBKE
Location (GRCh38)
1:206470332-206496891
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014002.4
Sequence length
3240.0 nt
GC content
0.5867

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1331.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1389.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 664.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001193321.2 NCBI
AGUGCUGAGCUUGGUGUCCCACCGCCACAAGGAGGCAGGGAAGAAACCC… 3121 nt 0.5857
NM_001193322.2 NCBI
AGUGCUGAGCUUGGUGUCCCACCGCCACAAGGAGGCAGGGAAGAAACCC… 3127 nt 0.5859
NM_014002.4 NCBI
AGUGCUGAGCUUGGUGUCCCACCGCCACAAGGAGGCAGGGAAGAAACCC… 3240 nt 0.5867
Summary

IKBKE is a noncanonical I-kappa-B (see MIM 164008) kinase (IKK) that is essential for regulating antiviral signaling pathways. IKBKE has also been identified as a breast cancer (MIM 114480) oncogene and is amplified and overexpressed in over 30% of breast carcinomas and breast cancer cell lines (Hutti et al., 2009 [PubMed 19481526]).[supplied by OMIM, Oct 2009]

Forensic Context

A study in Wistar-albino rats demonstrated that the IKBKE gene, identified as differentially expressed in response to mild traumatic brain injury, was down-regulated at 12 hours post-trauma and subsequently up-regulated at 48 hours [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].