Basic Information

Symbol
IKZF2
RNA class
mRNA
Alias
IKAROS Family Zinc Finger 2 ZNFN1A2 Helios Zinc Finger Protein, Subfamily 1A, 2 (Helios) Ikaros Family Zinc Finger Protein 2 Zinc Finger Protein Helios Zinc Finger DNA Binding Protein Helios IKAROS Family Zinc Finger 2 (Helios) ANF1A2 ZNF1A2 HELIOS ICHAD IMDIA
Location (GRCh38)
2:212999691-213152427
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001387220.1
Sequence length
9562.0 nt
GC content
0.3578

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2459.34 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2649.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2274.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001079526.2 NCBI
GCUAACCCUGCUCCUCGCUGAAGAUGGAGGAAGUAAAAACAGGAUUACC… 9484 nt 0.3570
NM_001371274.1 NCBI
CAAAAUAGUAAUAGUUGAGCUUCAUCUCAGACAUGAAUGUCUUUCUCAG… 9589 nt 0.3639
NM_001371275.1 NCBI
AUUUCUUGGUUUUGUUUAUCAGCCGAUCUGUUUGCUGGAUUUGGGCUUG… 9474 nt 0.3576
NM_001371276.1 NCBI
GCUAACCCUGCUCCUCGCUGAAGAUGGAGGAAGUAAAAACAGGAUUACC… 9380 nt 0.3563
NM_001371277.1 NCBI
CAAAAUAGUAAUAGUUGAGCUUCAUCUCAGACAUGAAUGUCUUUCUCAG… 9364 nt 0.3620
NM_001387220.1 NCBI
GCUAACCCUGCUCCUCGCUGAAGAUGGAGGAAGUAAAAACAGGAUUACC… 9562 nt 0.3578
NM_016260.3 NCBI
AUUUCUUGGUUUUGUUUAUCAGCCGAUCUGUUUGCUGGAUUUGGGCUUG… 9515 nt 0.3588
Summary

This gene encodes a member of the Ikaros family of zinc-finger proteins. Three members of this protein family (Ikaros, Aiolos and Helios) are hematopoietic-specific transcription factors involved in the regulation of lymphocyte development. This protein forms homo- or hetero-dimers with other Ikaros family members, and is thought to function predominantly in early hematopoietic development. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene, but the biological validity of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human patients demonstrated that the IKZF2 was upregulated in myocardial fibrosis (MF) compared to acute myocardial infarction (AMI) and downregulated in heart failure (HF) compared to MF, with ROC curve analysis showing an area under the curve (AUC) > 0.6 for AMI, indicating its potential diagnostic value [Wang et al. DOI:10.3389/fcvm.2021.664044].