Basic Information

Symbol
IL13
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 13 IL-13 P600 Interleukin-13 MGC116786 MGC116788 MGC116789 ALRH BHR1 Bronchial Hyperresponsiveness-1 (Bronchial Asthma) Allergic Rhinitis NC30
Location (GRCh38)
5:132656263-132661110
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002188.3
Sequence length
1283.0 nt
GC content
0.5253

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-472.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -494.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 276.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001354991.2 NCBI
ACGCGCGGGGGCGCCCCUGCCCACCGCUCCCGGCAGGGCUUUUGGUGGC… 1275 nt 0.5365
NM_001354992.2 NCBI
ACGCGCGGGGGCGCCCCUGCCCACCGCUCCCGGCAGGGCUUUUGGUGGC… 1454 nt 0.5440
NM_001354993.2 NCBI
ACGCGCGGGGGCGCCCCUGCCCACCGCUCCCGGCAGGGCUUUUGGUGGC… 1383 nt 0.5416
NM_002188.3 NCBI
AAGCCACCCAGCCUAUGCAUCCGCUCCUCAAUCCUCUCCUGUUGGCACU… 1283 nt 0.5253
Summary

This gene encodes an immunoregulatory cytokine produced primarily by activated Th2 cells. This cytokine is involved in several stages of B-cell maturation and differentiation. It up-regulates CD23 and MHC class II expression, and promotes IgE isotype switching of B cells. This cytokine down-regulates macrophage activity, thereby inhibits the production of pro-inflammatory cytokines and chemokines. This cytokine is found to be critical to the pathogenesis of allergen-induced asthma but operates through mechanisms independent of IgE and eosinophils. This gene, IL3, IL5, IL4, and CSF2 form a cytokine gene cluster on chromosome 5q, with this gene particularly close to IL4. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.