Basic Information

Symbol
IL13RA2
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 13 Receptor Subunit Alpha 2 CD213a2 IL-13R IL13BP CT19 Interleukin-13 Receptor Subunit Alpha-2 Interleukin 13 Receptor, Alpha 2 IL-13 Receptor Subunit Alpha-2 Cancer/Testis Antigen 19 IL-13R Subunit Alpha-2 IL-13R-Alpha-2 IL-13RA2 Interleukin 13 Receptor Alpha 2 Chain Interleukin 13 Binding Protein Interleukin-13-Binding Protein CD213a2 Antigen IL13R
Location (GRCh38)
X:115003975-115019977
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000640.3
Sequence length
1338.0 nt
GC content
0.3857

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-311.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -342.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 346.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(..((((((.....((((((.((........(((((((.((((((.((((((.((((.(((((.((...((.(((((...)))))..))....)).)))))........(((........)))......)))).)))))).)))).)).)))))))))))))))))))))..)..(((((...........(((......(((((.((((((((((.....((((((....).)))))....((((....))))...)))))))))).)))))......)))..(((.(((.(((...((((((........((....((((((((((....(((....)))))))))))))...))..((((.....))))..((((((((........(((((((((((..........))))).........))))))......))))))))))))))...)))))).)))............((((..((........))..))))......(((((((((..((((((((.(((((...(((.(((((((((((((((.((((((((...((..(((((((((((........))))).........((((((((((((..(((((((((((((((.((((......))))))))).........(((((((((((((((((((((((....((((......)))))))))...............)))))))).)))).......))))))....))))))).)))...)))))....(((((((((...(((((..(((((((((((((((((...((((.((..((((....((((....))))....))))...)).))))...(((((....((....)).....))))))))))).).))))))))))...)))))....)))))).)))......(..((((..((...((........))...))..))))..))))))))..................))))))..))..)))).)))).))))))))))..........(((((((((.(((...(((((.((((.....)).....((((.(((((.((((.((.(((((....))))).)).)))).(((((((...((((((.((...((((....))))....)).))))))...((....)))).)))))..))))).))))...(((..(((((((...))))).))..))).........((((.((....)).))))..)).))))).))).)))).))))).))))).)))...))))))))))..)))..))))))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{((((((((((((((((....,,{,,,.{{({{|{{.....,,.(((((.((........)).))))).,})}.|}}}}....,,,,}}}..))))))))))))))}|.{(((((((((((..............))))))}})).)}},,,,{((,({,{(({.{((((........))))}..}})}....||({({.,,(((({.((((((((((.....((((((....),,))))....{(((....)))}...)))))))))).}))))..,...)))}.(((.(({.(((,,.((((((........,,....((((((((((....(((....)))))))))))))...||,.({({.....)))),,{(((((((........(((((((((((..........))))).........)))))).,....)))))))}))))))..,)))))).))).........,.,(((,..{{.|,....}},,,||||{,,...,{(((((((..(((((({{.((({(...{((.(((((((((((((((.((((((((...,,..(((((((((((.({{{{({{{,,{{{{{.{,...,{,...(((((..(((((((((((((((,((((....,})))}})))).{{{{{...,|||||{{({{((((((((((((....((((......)))))))))...||.....,..,,)))))))).}}}}..,,,.,}}}}}}....))))))).)))...)))))...,(({,.(((((((((.....((((,...{{,((((.(((..(((..{.......,..})}))).))))},..}))).....))))))))},}|||.{{((({{(((({....})))),.})))))),,,,,,,.}}.}}))).,)))}}}))))...,,,|,..,..{{{(,,((...||}},.....}}...},..)))),,|....,,...............,...))))))..}}..))))}}})).)))))))))}...,,,.,..{({{{{{{{,|||||||,{{{|{{||,,,,..}..,..((((.(((((.{(((.{{.(((((....))))).}}.)))}.{((({{{,...,((({.((...{(((....}}))....)).)))))},.,((....)))},})))}..))))).))))...{{{|,{|((((,...})))).)),.))},.......,||||,||..,,||,,|}|,|||{}}}}..))}.}})),))))),))))).))),..))))}))))}}.,}}..))))))))),,,,}.)}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000640.3 NCBI
CUUCCGGAUGAAGGCUAUUUGAAGUCGCCAUAACCUGGUCAGAAGUGUG… 1338 nt 0.3857
Summary

The protein encoded by this gene is closely related to Il13RA1, a subuint of the interleukin 13 receptor complex. This protein binds IL13 with high affinity, but lacks cytoplasmic domain, and does not appear to function as a signal mediator. It is reported to play a role in the internalization of IL13. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.