Basic Information

Symbol
IL15RA
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 15 Receptor Subunit Alpha IL-15RA CD215 Interleukin-15 Receptor Subunit Alpha Interleukin 15 Receptor, Alpha IL-15 Receptor Subunit Alpha CD215 Antigen IL-15R-Alpha
Location (GRCh38)
10:5943639-5978187
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002189.4
Sequence length
1566.0 nt
GC content
0.5594

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-564.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -591.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 304.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001243539.2 NCBI
GACACCUCCGCGGGCACUCACCCAGGCCGGCCGCUCACAACCGAGCGCA… 1697 nt 0.5616
NM_001256765.1 NCBI
AAAAGCGAAAGCGAAUGCGACUGGCGGGGCGGCAGGUCCCAGAGCAGCG… 1810 nt 0.5597
NM_001351095.2 NCBI
GUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUAGUCUCG… 2003 nt 0.5227
NM_001351096.1 NCBI
AUGCAAGAGACAGGCUGGCUGUCCUGGCGGGAAGGAGCAGAAUAUCUGA… 1840 nt 0.5326
NM_001351097.2 NCBI
GACACCUCCGCGGGCACUCACCCAGGCCGGCCGCUCACAACCGAGCGCA… 1598 nt 0.5569
NM_002189.4 NCBI
CUGGGCAGCGCUCGCCCGGGGAGUCCAGCGGUGUCCUGUGGAGCUGCCG… 1566 nt 0.5594
NM_172200.3 NCBI
CUGGGCAGCGCUCGCCCGGGGAGUCCAGCGGUGUCCUGUGGAGCUGCCG… 1467 nt 0.5542
Summary

This gene encodes a cytokine receptor that specifically binds interleukin 15 (IL15) with high affinity. The receptors of IL15 and IL2 share two subunits, IL2R beta and IL2R gamma. This forms the basis of many overlapping biological activities of IL15 and IL2. The protein encoded by this gene is structurally related to IL2R alpha, an additional IL2-specific alpha subunit necessary for high affinity IL2 binding. Unlike IL2RA, IL15RA is capable of binding IL15 with high affinity independent of other subunits, which suggests distinct roles between IL15 and IL2. This receptor is reported to enhance cell proliferation and expression of apoptosis inhibitor BCL2L1/BCL2-XL and BCL2. Multiple alternatively spliced transcript variants of this gene have been reported.[provided by RefSeq, Apr 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the IL15RA transcript increased in relative abundance within 0.5 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].