Basic Information

Symbol
IL17RE
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 17 Receptor E Interleukin-17 Receptor E IL-17 Receptor E FLJ23658 IL-17RE
Location (GRCh38)
3:9902612-9916402
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_153480.2
Sequence length
2679.0 nt
GC content
0.6193

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1160.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1210.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 609.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001193380.2 NCBI
GUGUUCGCUGCUGCACAGCAAGGCCCUGCCACCCACCUUCAGGCCAUGC… 2752 nt 0.6199
NM_153480.2 NCBI
GUGUUCGCUGCUGCACAGCAAGGCCCUGCCACCCACCUUCAGGCCAUGC… 2679 nt 0.6193
NM_153481.2 NCBI
GUGUUCGCUGCUGCACAGCAAGGCCCUGCCACCCACCUUCAGGCCAUGC… 2543 nt 0.6221
NM_153483.2 NCBI
AGAAAUGGGUGCGUCCCCCAACCUGAUGCUAGCCCCUUUCCUGUUACUU… 2736 nt 0.6133
Summary

This gene encodes a transmembrane protein that functions as the receptor for interleukin-17C. The encoded protein signals to downstream components of the mitogen activated protein kinase (MAPK) pathway. Activity of this protein is important in the immune response to bacterial pathogens. Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2013]

Forensic Context

A study in humans using platelet transcriptome data from patients with ST-segment elevation and non-ST-segment elevation myocardial infarction identified the IL17RE as a hub gene in a co-expression module significantly associated with STEMI, where it was functionally linked to cell membrane signal transduction [Zhang et al. DOI:PMC8129354].