Basic Information

Symbol
IL18BP
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 18 Binding Protein IL18BPa MC51L-53L-54L Homolog Gene Product Interleukin-18-Binding Protein Tadekinig-Alfa IL-18BP FVH
Location (GRCh38)
11:71998613-72007315
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001039660.2
Sequence length
1697.0 nt
GC content
0.5563

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-576.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -604.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 426.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((.(((......)))..((((......))))....(((((((((((((((((...))).)))))).((((.(((.(((((((.(((....))))))))))(((((((.((((.(.....((((.((.(((...(((((....((...........))....((((((.((((.((.(((((.((((((....((((((.....)))..)))...))).))).))).)).))...)))).))))))))))).....(((..((((..((((..(((((((((((...((((.((((.......(((((((..((............((((((((....((.((...)).))....)))))))).......((((...(((((....((((..(((..(((..(((((((((((((((((((((.((((....(((...........))).........((((((((((((((.....))))))....(((((((.(.....).)))))))(((((....((((((((((((((.(((((((......((((((((.(((...(((((((...))))..)))...))).))))))))..........))))))).))((((((((((....)))..))))).)).)))))..)))))))...)))))((((.(((((..(((((....)))))...........))))).))))))))))))..)))).))))....)))))).)))).))))))...)..))).)))..)))).)))))..)))).))..))))))).....)))).))))))))..(((((...)))))...))).)))).)))).))))..)))......))).)).))))....).)))))))))))..............))).))))...............................(((((.((((((.......((((((((((.....(((....(((......(((((....(((.......(((((.(((((..((((....(((((..((((((((....((((((.....)))))).......)))).................(((....)))))))...)))))..))))..)).))).((((((((((((((((((((((...(((((((.((((((..((..((((....)))).......((((((((.(((((((((((((((....((((...(((((....((((((((.((.(((..(((((((...........)).)))))..............((((((.((....((((....))))))))))))))).)).))).)))))....(((((((.........((((.......)))))))))))......)))))..))))..)))))))....).)))...)))).)))))))).((((((.......)))))).......((((....))))))..))))))..))))))).......(((((..............))))).(((((.((..((.(((....................)))))....)).)))))..)))))))))).....)))).)))))))))))))..)))..))))))))....)))....))).))))))))))))).)))))..)))))))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((,(((......)}).,((((......))))....(((((((((((((((((...})),,))))),{,,{{(({,((((.,,.,(({{{{,,.,||||||((((((((((..,{{(({..,||,,,.((((..(({||.,,.||,,.||{{{{..{{.{{.((((((.((((.((.(((((.((((((....,,((((.....)))}..|}..,})).))).))).)).))...)))).))))))|}|},,...,{((..{|||}.{{,({,{{(((({(((({{.,{((,({(,.{{{,..{(({{{{.,({......|||,..{{{(((({....{{.{{...)),))}..,)))}})))..}}}.,||||,|||{((({,..((((..{{(..{((..{(((((({(({{{{{({((((,{{{{.,,,||{..........,))).........((((((({((((((.....))))))....(((((((.(.....).))))))){((((....(((((({{((((||,{({{{{{...|,,((((((((.(((...(((((((...))))..)))...))).))))))))..........}}}))))})))|{(((((((....)))..))))}}),))))))..)))))))...)))))((((.((((({.(((((....))))).,.........))))).)))),))))))|,.||||,|}|||,,,||||||,,}}}.}||}}}..,|,.}}}.}}}..))}}.}))}}}.}}}}.))..)))))))..,}})}}}.}}}}}))}..{|{{|,,,)})))..,)),)))))})))).)))),.}},.....)))},)))))))}}}})})))),,,,,,,...............,,.,.,,...,......},.......}}}}}}|}}...(((((.((((((.......((((((({{(.{,{.(((....(((......(((((....{{{.......(((((.{{({(..((({....(((({..(({(((((....((((((.....)))))).......)))},..,..........,,|||||,.....}}}}...})))).,)})}..)),})).((((((((((((((((((((((...(((((((.((((((..,{..((((....))))...{,,.((((((((.(((({{({(((((((....((((...(((((....((((((((.((.(((..((((({(...........)}.)))))..............((((((.((....((((....))))))))))))))).)).))).)))))....(((((((,,,......{|||.......}}}})))))))......)))))..))))..)))))))....}.}}}...)))).)))))))).|||{{{.....,.||}}|,...},,}|{{{....))))))..))))))..))))))).......(((((.,..,.........))))).(((((.((..((,(({,...................})))}....)).)))))..)))))))))).....)))).)))))))))))))..)))..))))))))....)))..,)))}.))))))))))))).))))),,)))))))))))))))....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039659.2 NCBI
GUAUUUCCUGUGGUGGGUUCACACGCAGCUAGACACAGCUAACUUGAGU… 1809 nt 0.5539
NM_001039660.2 NCBI
GUAUUUCCUGUGGUGGGUUCACACGCAGCUAGACACAGCUAACUUGAGU… 1697 nt 0.5563
NM_001145055.1 NCBI
AGAAGAGGACGUUGUCACAGAUAAAGAGCCAGGCUCACCAGCUCCUGAC… 1053 nt 0.5432
NM_001145057.1 NCBI
AAGCAGCUCUGGUGCUGAAGAGAGCACUGCCUCCCUGUGUGACUGGAGA… 1371 nt 0.5602
NM_005699.3 NCBI
GCCAGAGGGGCUAGGAUGAGAGACAGAGGGUGUGAUGGUGGGUGCUGGG… 2796 nt 0.5440
NM_173042.2 NCBI
GCCAGAGGGGCUAGGAUGAGAGACAGAGGGUGUGAUGGUGGGUGCUGGG… 2189 nt 0.5505
NM_173044.3 NCBI
GUAUUUCCUGUGGUGGGUUCACACGCAGCUAGACACAGCUAACUUGAGU… 1569 nt 0.5500
Summary

The protein encoded by this gene functions as an inhibitor of the proinflammatory cytokine, IL18. It binds IL18, prevents the binding of IL18 to its receptor, and thus inhibits IL18-induced IFN-gamma production, resulting in reduced T-helper type 1 immune responses. This protein is constitutively expressed and secreted in mononuclear cells. Elevated level of this protein is detected in the intestinal tissues of patients with Crohn's disease. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

A study in porcine skin exposed to sulfur mustard or thermal burn injury demonstrated that the IL18BP was significantly increased at 7 days postexposure [Price et al. DOI:10.080/15569520903097754]. Another study in porcine skin exposed to bromine vapor also noted the IL18BP was upregulated [Rogers et al. DOI:10.1002/jbt.20383].