Basic Information

Symbol
IL18R1
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 18 Receptor 1 IL-1Rrp IL1RRP CD218a CD218 Antigen-Like Family Member A Interleukin-18 Receptor Alpha IL1 Receptor-Related Protein Interleukin-18 Receptor 1 IL-18R-Alpha IL-18Ralpha CDw218a Cytokine Receptor CD218a Antigen IL18Ralpha2 EC 3.2.2.6 IL-18R-1 IL-18R1 IL1R-Rp IL18RA
Location (GRCh38)
2:102311529-102398777
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003855.5
Sequence length
4149.0 nt
GC content
0.4259

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1201.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1278.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1379.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282399.2 NCBI
UCAGGAGGCGGAGAUCGCUGCUUCUCACCUACUUUCUGAACUUGGCCUC… 3471 nt 0.3964
NM_001371418.1 NCBI
GGGACCCGCGCCGCGCGGCUGGGCAGGAAGCGCCAGACGCCUGGGGCCC… 4145 nt 0.4258
NM_001371419.1 NCBI
GGGACCCGCGCCGCGCGGCUGGGCAGGAAGCGCCAGACGCCUGGGGCCC… 2103 nt 0.4536
NM_001371420.1 NCBI
GGGACCCGCGCCGCGCGGCUGGGCAGGAAGCGCCAGACGCCUGGGGCCC… 2100 nt 0.4533
NM_001371421.1 NCBI
GGGACCCGCGCCGCGCGGCUGGGCAGGAAGCGCCAGACGCCUGGGGCCC… 4061 nt 0.4262
NM_001371422.1 NCBI
GGGACCCGCGCCGCGCGGCUGGGCAGGAAGCGCCAGACGCCUGGGGCCC… 3904 nt 0.4260
NM_001371423.1 NCBI
GGGACCCGCGCCGCGCGGCUGGGCAGGAAGCGCCAGACGCCUGGGGCCC… 3901 nt 0.4258
NM_001371424.1 NCBI
GGGACCCGCGCCGCGCGGCUGGGCAGGAAGCGCCAGACGCCUGGGGCCC… 3735 nt 0.4316
NM_003855.5 NCBI
GGGACCCGCGCCGCGCGGCUGGGCAGGAAGCGCCAGACGCCUGGGGCCC… 4149 nt 0.4259
Summary

The protein encoded by this gene is a cytokine receptor that belongs to the interleukin 1 receptor family. This receptor specifically binds interleukin 18 (IL18), and is essential for IL18 mediated signal transduction. IFN-alpha and IL12 are reported to induce the expression of this receptor in NK and T cells. This gene along with four other members of the interleukin 1 receptor family, including IL1R2, IL1R1, ILRL2 (IL-1Rrp2), and IL1RL1 (T1/ST2), form a gene cluster on chromosome 2q. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2013]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the IL18R1 is downregulated in myocardial fibrosis versus acute myocardial infarction and upregulated in heart failure versus myocardial fibrosis, showing involvement in TNF signaling and cytokine-cytokine receptor interaction pathways and possessing potential diagnostic value for acute myocardial infarction [Wang et al. DOI:10.3389/fcvm.2021.664044]. Another human study found the IL18R1 was elevated in heavier monozygotic twins within an immunometabolism component, indicating an association with obesity [Kibble et al. DOI:10.1098/rsos.200872].