Basic Information

Symbol
IL18RAP
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 18 Receptor Accessory Protein AcPL CD218b Interleukin-18 Receptor Accessory Protein CD218 Antigen-Like Family Member B IL-18 Receptor Accessory Protein Interleukin-18 Receptor Beta Interleukin-1 Receptor 7 IL-18R-Beta IL-18Rbeta IL-18RAcP IL-1RAcPL CDw218b IL-1R-7 IL-1R7 Interleukin-18 Receptor Accessory Protein-Like Cluster Of Differentiation W218b IL-1R Accessory Protein-Like Accessory Protein-Like IL-18 Receptor Beta CD218b Antigen EC 3.2.2.6 IL18RB IL1R7
Location (GRCh38)
2:102418570-102452567
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001393487.1
Sequence length
2302.0 nt
GC content
0.4422

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-682.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -726.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 568.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((........)))))))...(((((..(((((((...))))))))))))...........(((((((.((((...(((((..(((..((((((.(.(((((((((((......(((..((((((((((....((((((((..((((..((((.((.((..((((..(((........)))(((.(((((((..............)))).))).))).((((((((((((.((.(((((((((.(((((((.(((....))).))))))).....(((((((...))))))).((((............))))....(((..((((((.....))))))...........(((((((((...(((.......))).((.(((((....))))).))))))))))).....)))...............)))))))))...)))))))))))))).....((((((...(((((((((((((((....))).))))).)))..))))...)))))).))))...)))).))))..))))..))....))))))..)).))))))))...))))))))))....))))))))))).....(((((......)))))((((((((...((((((.((((..((((.....((((.....(((...)))......))))......))))..))))))))))..((((((((((.((((..(((((((.(((((.....((((((((((((.(((((....(((((((.((((.((((.(((((......))))).)))))))).)))).)))..)))))))))).)))))))((((....(((...)))....)))).........(((((...))))).(((((.(((((((((.((((.(((((.....((....)).....))))).(((....)))......(((((((((.(((((.....))))).)).....((((((..((((.((((....(((((((((((..(((((((...))))))).............))))))))..)))....)))).))))......)))))).......))))))).)))).))).))))))))))).))))).))))))).))))....((..(((((...((......))...)))))..))......))))))))))))))))))........((((((((.(((((.((((..(((((((((((((.(((((((((((((..........))))))............)))))))))).))).)).)))))...............(((((((......(((((..(((.....))).))))).....((((((.((((....(((((((......((((((......))))))..)))))))....)))))))))).((((....))))....(((((((((.......)))))))))..(((.((((((.((((((..(((..((((...((((((......(((((..............((..((((..........))))..)).........(((....))).((((...(((((.(..((((..((((......))))))))...).))))).))))...)))))..........)))))))))))))..))))))..))))))...)))(((((........((((.((((((((....(((.((..(((....(((((.......(((((((((((((((((((((((((((.....((.(.(.((((((.((((.((.....)).)))).))....))))).)))))))))))).....))))))))....(((((.......((....)).......)))))))))))))))...))))))))..)).)))....))))))))))))(((((((((((((((((..(.((((....)))).).)))).((((.((((((.....)).)))).))))..((((.(((((.((((...)))).))))).))))..((((....)))).)))))..))))).)))..)))))((..(((((((((.....(((((.((.(.(((......)))).)).))))))))))))))..))(((((...))))).......)))))))...)))).)))))))))))))............)))..)))))..))))...)))))))....(((((((.(((........))).)))))))....((((....)))).((.((((((......)))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((........))))))).(((((.....(((((.(((((..(({...})}....))))).))))|(({{{((((({.,,,..,,,..((((((.(.(((((((((((......(((..((((((((((....((((((,,,{((((,{{{{(,((,(({,,{{{,,(((,,,.....,{,.((,,,,,||..,,,...{{|||||||{{.....))}},|||||||{(((,{(.{{{{{||||.,||{((({{{{....,,,.,,||})}}},,,|((((((...))))))),|,||},,.....,,,,))))..,|||...((((((.....))))))..........,(((((((((...(((.......))).{(.{((((....))))).)})))))))))}....,,,...,,.|{{{{{,..}||}||||}...}}}}}}}}}})))).....((((((...(((((((((((({((....})).)))))},))..))))...)))))),})))}}.))}}.)))),,))))..}}....))))))..)))))))))))...))))))))))....))))))))))).....(((((......)))))(((((....)))))})))))))),.(((((((((((((,,,(({(((((.....((((({{(,......(((.(((({,((((....((((((((((((((((((((..((({(({((..((({(({(((({.(((((.{{.({,((((.((((.((((.(((((......))))).)))))))).)))).}))}.)))))}}))).}}}}}}|{{(,....(((.,{{|,{{{.,,,....}}}...(((((...))))).((((,.,,|||||||,{||}.{((,{.,|||||,.,,}}.....}}}}}.(((....))),}}}}}}))}|}{((.(((((.....))))).))}....,,(((((.{{,,,(((({{.{({,,,,||{||,,||||{{|,,,)}}}}||{,,,,{{{{{{{{|||}}|||..|||{{{{,||,.|}},..}}..}.))))}))..,,,,,|||,{||||,|||{||||}||}||}.{{|||,{{|||||{||||,...,,,.{((({...,{......||..,}}}}},|,.......,,{((((((.((((((((((,....{(.((.((({.{((((((....)))))))))).)).))))).)))))))))))))}((((((((((........)))))),.)))),.,)))}....}}}}))}}},}})},})||}|}|||||....,|}}|}}}}))}))))}}),))||,{,,...}})).)))))))))){((((,.,.|||}},.{((((,{(({,...{|||||..,({{(((((((((((((((....))))....(((((((((......,)}))))))).,,....)))))).))))}.}))..}}||||.{{({,,,....,}})}.)),))}},.}}}},.})))}})))))...))))))))).))).......))}...)))))...))))),}}}.,,,....)))))((.((.(((.((((((((.{.,,,{{{{,|{,,.,,...........}))),}))},,.)))))).)).))).)).))...((((...}))).....((((.((((((((....(((.((..(((,...{((((.......(((((((((((((((((((((((((((.....((.{.{.((((((.((((.((.....)).)))).))....))))..}}}))))))))}....,)))))))}....(((((.......((....)}.......)))))))))))))))...))))))))..)).)))....))))))))))))(((((((((((((((((..(.((((....)))).).)))).((((.(((({(.....)},)))).)))).,((((.(((((.((((...)))).))))).))))..((((....)))).)))))..))))).)))..)))))))).(((((((((.....(((((.((.(.(((......)))).)).)))))))))))))){((.(((((...))))).))}..)))))..{,,((((((((.((..(.((((((..((.........))..)))))))..)).))).)))))..|||,,||.|,,..{{{{.{(((((({......)))))))}..)))).{(.((((((......)))))).))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001393486.1 NCBI
CUUCUUCAGAGCACUUCCUACUGAAAGAGGUAUCUCUCUGGAUAGGAAG… 2701 nt 0.4354
NM_001393487.1 NCBI
CCAUUUCUUGAUUUACAGAAAUGAAGGGGAUACUCAGGGCAGAGUUCUG… 2302 nt 0.4422
NM_001393488.1 NCBI
GGUAGUUUAUUUGAUUUUCCUCUGUAUGACCAUCCAUUUCACAAUGUCC… 3017 nt 0.4329
NM_001393489.1 NCBI
CUUCUUCAGAGCACUUCCUACUGAAAGAGGUAUCUCUCUGGAUAGGAAG… 2376 nt 0.4386
NM_003853.4 NCBI
GGUAGUUUAUUUGAUUUUCCUCUGUAUGACCAUCCAUUUCACAAUGUCC… 2813 nt 0.4316
Summary

The protein encoded by this gene is an accessory subunit of the heterodimeric receptor for interleukin 18 (IL18), a proinflammatory cytokine involved in inducing cell-mediated immunity. This protein enhances the IL18-binding activity of the IL18 receptor and plays a role in signaling by IL18. Mutations in this gene are associated with Crohn's disease and inflammatory bowel disease, and susceptibility to celiac disease and leprosy. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but their full-length nature is not known. [provided by RefSeq, Feb 2014]

Forensic Context

A study in human skin tissue from burn patients demonstrated that the IL18RAP was expressed in a cluster of burn tissue γδ T cells (Vδ2 subset) [Labuz et al. DOI:10.7554/eLife.82626]. A separate microarray analysis of human skin after thermal injury found that the IL18RAP gene was significantly up-regulated in burned tissue compared to normal skin [Greco et al. DOI:10.1016/j.burns.2009.06.211]. A study in humans demonstrated that IL-18RAP mRNA expression was increased in septic patients compared to those with systemic inflammatory response syndrome and healthy controls [Ma et al. DOI:10.1371/journal.pone.0075918]. In a rat model of radiation-induced lung injury, single-cell transcriptomic analysis identified the IL18RAP as an orthologous gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].