Basic Information

Symbol
IL19
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 19 ZMDA1 NG.1 IL-10C IL-19 MDA1 Melanoma Differentiation Associated Protein-Like Protein Interleukin-19 Melanoma Differentiation-Associated Protein-Like Protein
Location (GRCh38)
1:206770764-206842981
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Mixture deconvolution
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_153758.5
Sequence length
1347.0 nt
GC content
0.4915

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-443.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -470.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 330.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001369605.1 NCBI
AGAGAGCACUGAGAGGAGACACAAGGAGCAGCCCGCAAGCACCAAGUGA… 947 nt 0.4741
NM_001393490.1 NCBI
AGUCUUUCCUCAUUUACAGCUAGCUCUGCCAGUCUGUGUCUUUGCUGUG… 1099 nt 0.4786
NM_001393491.1 NCBI
AGAGAUGUGGUCUCGCUUUGUUGCCUACACUGGUCUCAAACUCUUGGCC… 990 nt 0.4737
NM_013371.5 NCBI
AGAGAUGUGGUCUCGCUUUGUUGCCUACACUGGUCUCAAACUCUUGGCC… 1677 nt 0.4627
NM_153758.5 NCBI
AGUCUUUCCUCAUUUACAGCUAGCUCUGCCAGUCUGUGUCUUUGCUGUG… 1347 nt 0.4915
Summary

The protein encoded by this gene is a cytokine that belongs to the IL10 cytokine subfamily. This cytokine is found to be preferentially expressed in monocytes. It can bind the IL20 receptor complex and lead to the activation of the signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3). A similar cytokine in mouse is reported to up-regulate the expression of IL6 and TNF-alpha and induce apoptosis, which suggests a role of this cytokine in inflammatory responses. Alternatively spliced transcript variants encoding the distinct isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the IL19 as a candidate mRNA biomarker for the putative identification of vaginal secretions, where it showed no cross-reactivity with saliva but was relatively insensitive, being detected in only 2 out of 5 vaginal samples, making it more suitable for a quantitative (qRT-PCR) assay format [Hanson et al. DOI:10.1016/j.scijus.2012.03.007]. In a subsequent human study, the IL19 was incorporated as a positive control mRNA marker to indicate the presence of vaginal secretions within a multiplex PCR and SNaPshot mini-sequencing system designed for deconvoluting semen donors in body fluid mixtures [Liu et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2021.102483].