Basic Information

Symbol
IL1R1
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 1 Receptor Type 1 D2S1473 CD121A IL1RA IL1R CD121 Antigen-Like Family Member A Interleukin-1 Receptor Type 1 Interleukin-1 Receptor Type I Interleukin-1 Receptor Alpha IL-1R-Alpha IL-1RT1 P80 Interleukin 1 Receptor Alpha, Type I Interleukin-1 Receptor, Type I Interleukin 1 Receptor, Type I CD121a Antigen EC 3.2.2.6 IL-1RT-1 IL-1R-1 IL1RT1 CRMO3
Location (GRCh38)
2:102063933-102179874
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000877.4
Sequence length
5183.0 nt
GC content
0.4447

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1548.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1648.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1280.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000877.4 NCBI
AGUUCCCGGCCGCGAGGGCGGGCGCAGCUUGUGGCCGGCGGCCGGAGCC… 5183 nt 0.4447
NM_001288706.2 NCBI
ACUUGUAUCUUUUCAUAUCAAAAAUGGGAGGUGACACCCAGUUUAAGGA… 4959 nt 0.4263
NM_001320978.2 NCBI
ACUUGUAUCUUUUCAUAUCAAAAAUGGGAGGUGACACCCAGUUUAAGGA… 5052 nt 0.4258
NM_001320980.2 NCBI
AUCUCCAAAACCCCACUUUCUCCUUCCUUUGAGCCUCCGUACCAGCUGG… 5177 nt 0.4298
NM_001320981.2 NCBI
GAAGACCUCCAAACAAGCUGGAGGGGCCAGUCACUUGCUGAAGACUAGC… 5036 nt 0.4307
NM_001320982.2 NCBI
AGUCGGAGAGAGCCCCUGGCCAGGCACCAAGCUCCAGAGGUCGCUCUGG… 5058 nt 0.4318
NM_001320983.1 NCBI
GUAGACGCACCCUCUGAAGAUGGUGACUCCCUCCUGAGAAGCUGGACCC… 4858 nt 0.4251
NM_001320984.1 NCBI
GUAGACGCACCCUCUGAAGAUGGUGACUCCCUCCUGAGAAGCUGGACCC… 4735 nt 0.4275
NM_001320985.1 NCBI
GUAGACGCACCCUCUGAAGAUGGUGACUCCCUCCUGAGAAGCUGGACCC… 4756 nt 0.4254
NM_001320986.2 NCBI
AUCUCCAAAACCCCACUUUCUCCUUCCUUUGAGCCUCCGUACCAGCUGG… 904 nt 0.4137
Summary

This gene encodes a cytokine receptor that belongs to the interleukin-1 receptor family. The encoded protein is a receptor for interleukin-1 alpha, interleukin-1 beta, and interleukin-1 receptor antagonist. It is an important mediator involved in many cytokine-induced immune and inflammatory responses. This gene is located in a cluster of related cytokine receptor genes on chromosome 2q12. [provided by RefSeq, Dec 2013]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the IL1R1 as a shared upregulated differentially expressed gene in left ventricular tissue from animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to adult human HCM cases [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4]. In human corpus cavernosum, single-cell transcriptome analysis characterized the IL1R1 as a specific marker highly expressed in the EC2 endothelial subcluster [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9]. A study in humans and rats demonstrated that ultraviolet-B irradiation induces significant transcriptional changes in skin, with the IL1R1 being upregulated in both species (fold change 32.5 in human and 26.6 in rat skin) at the peak of hyperalgesia [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].