Basic Information

Symbol
IL1RL1
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 1 Receptor Like 1 DER4 ST2 T1 FIT-1 IL33R ST2L ST2V Homolog Of Mouse Growth Stimulation-Expressed Interleukin-1 Receptor-Like 1 Interleukin 1 Receptor-Related Protein Growth Stimulation-Expressed Protein ST2 EC 3.2.2.6
Location (GRCh38)
2:102311502-102352353
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016232.5
Sequence length
1997.0 nt
GC content
0.4367

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-556.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -594.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 665.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((...((((.(....(.(((((..........))))).).(((((......))))).......).))))..))).)))))).(((((((.((((((((((....((.((((((((((((((((((((.(((((((....(((((((.....(((....)))......)))))))..))))(((((.(((...((((...(((((((((..(((........)))..))).).)))))....))))...))).)))))..........(((((..((((((((........)))))))))))))...(((((.((((((((........(((...((((.....))))...)))..((((((.((.......((((......)))).......)).))))))..(((((......)))))........((((((...((((((((....((((....)))).((((.(((...(((((...........))))).)))))))((.((((.(((........((((((.((((......((.(((((((...((((.....))))....))))))).))........((((((..((((((.((((......((((.((.(((..((......))..))))).))))..((((..(((..((((.((...((((((((.((..(((((.(..(((.((((((((((((........)))))))))))).(((((((....)))))))........((((.((((...((....)).)))).))))))))))).))..))))))...))))...)).))))..)))..)))).((((((.......(((.....)))........)))))).))))))))))..)))))).....((((.......)))))))).)))))))))....)))).)).(((((.((((((((.....))))))))....)))))..........(((((((((...((.....(((.....)))....))....))))))))))))))))).)))))))))))))))))))((((........))))))))))))))....((((((.((.((((((((((..(((((((((.((......)).)))).....)))))...)))...)))..)))).))))))))......)))))))).))).(((((((....)))))))........((((((((((.((((((......)))))).)))..)))))))(((((((((.((((.(((((((((((.................(((.........))).((.(((((....))))).))...((((((((((((.((.(..((((((..(((((...(.((.((((.((((..((.(((((...)))))))..))))..)))).)).)((((....((((((((((.....))....))))))))....))))........))))).....))))))..)))..)))))...)))))))....)))))))).((((..........((((....))))...((((........)))).)))).....(((((.(....))))))...))).))))))))))))))).))...)))))))))).))))))).(((((.(((((..(((.......))).(((((((((((..((((((.(((((((((...((((.((......)).))))........)))))))))((((...............)))))))))).......((((((((....((..(((((.........)))))..))....)).))))))..))))).))))))..((((((((((...((((..((...((((((((........))..)))))).))..)))).))))((((((.((((((......(((....)))...((((....)))))))))))))))).....))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{(((((,,..{{,(((({{{..{((((.((((((..,..{{....,.(((((......)))))...,..})..}..))))))))))}{.{{{,,{(,({({{(((((,{{.{{.,,.,||{||||||,,,{((({(.{,,,,,.}|||||(((..,,,{{(,,,.|||......)})}}}}..,,}}{||{|,|||||||{,{..,{{{{{{{{{..{{{........)))..))),)}))))}..,{|||,.|||||,||||,.||,,.,...{{{{{..{(((((((.,......})))|||||,|}}.,,{{({({{.{{{.(({....}}}.}}}..,,||||||||}||.|||||.....,,...,....,,.{(((......)))}.......({({((({,.(((((({{{,,,{{{{{.{{,,.{{{(((,..({(..,|||,..}}||||....,,,|{{.....|))).(((((...........))))).|{{{(,,,.}}}}}..............,|,,}}}}},|||,.{(.(((((((..,((((.....)))).,..))))))).)),.....,,||,....,,,,.,{((((({((.(((((({......{{|{{{{{....{(((((|.,.|}}}}||.,}})},}|,,..,,.})}.}}}}))},,||||||,....{{(.{{((((((((((,......,)))))))))))),(((((((....)))))))....,,,,.,,,.||||...,({.{{||.,,||{|||||.((((((((...(((((((({{(({.{{{.((((,,(||{{{|||,{{{(((({{,..,{,|,{,.{{{...,,...,,......||}{{{|||,.,|||}},,....,}},.....,))))))}}|,}||||||}...,)))},..,.(((((.((((((({.....})))))))....))))).........{(((((((((...((.....(((.....)))...,))....)))))))))}((((.....))))|||,,|||{|||..,|||,..,}}..)))))))))))))))...)).....)))))),..}}}}}))}}.}}))))||...}}})}}))))}}}}.)))))))}.,,...,,,.,}},|{|..,,)))..||{.,|{{{{(,(((,.(((((((....))))))),}}.}}},{{{{{{{|{{.{{{(({......)))))).))}..}}}}}}}(((((((({{((((.((({((((((({,.,,,.,,.,,|,...{{{........,}}}.{(.(((((....))))).)).}}|{{(((({{{{{.{{.(,.((((((..(((((.,,{.((.((((.((((.,({.(((({...)))))}}},))))..)))).)).}{{{{....((((((((((.....,|...,))))))))..,.)))},.,},}},))))).....))))))..)}}..)))))...))))))}....)))))))}.((((..........((((....))))...((((........)))).}))).....(((((.(....))))))...))).))))))))))))),..{{{{{||,||,,}},.}}}||||{{{((((({..{,}||||,..,,,,|||{(((({{{({{,{{(((((.(((((((((...{({,.{{......||,||||...,,,,,)))))))))((((...............)))))}}}}|.......{((((({{...,{{..(((({.....,,,})))))..))....))})))))}.,)))))}),)))),.)))))))})|||.,,...))}.,..|||||}}}}}},,},})).||||}}||{{{{||,,,,,,((((((.((((((...{{,(((....))).,,{(((....)))})))))))))))}........)))))))))))),

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282408.2 NCBI
GAGUUGUGAAACUGUGGGCAGAAAGUUGAGGAAGAAAGAACUCAAGUAC… 3511 nt 0.4156
NM_003856.4 NCBI
GAGGAGGGACCUACAAAGACUGGAAACUAUUCUUAGCUCCGUCACUGAC… 3885 nt 0.4160
NM_016232.5 NCBI
GAGUUGUGAAACUGUGGGCAGAAAGUUGAGGAAGAAAGAACUCAAGUAC… 1997 nt 0.4367
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the interleukin 1 receptor family. Studies of the similar gene in mouse suggested that this receptor can be induced by proinflammatory stimuli, and may be involved in the function of helper T cells. This gene, interleukin 1 receptor, type I (IL1R1), interleukin 1 receptor, type II (IL1R2) and interleukin 1 receptor-like 2 (IL1RL2) form a cytokine receptor gene cluster in a region mapped to chromosome 2q12. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans and rats demonstrated that ultraviolet-B (UVB) irradiation significantly upregulates the IL1RL1 gene in skin at the peak of hyperalgesia, with a fold change of 32.5 in human skin and 26.6 in rat skin, indicating its role in the inflammatory response [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].