Basic Information

Symbol
IL21
RNA class
mRNA
Alias
Interleukin 21 IL-21 Za11 Interleukin-21 CVID11
Location (GRCh38)
4:122610108-122621066
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021803.4
Sequence length
3146.0 nt
GC content
0.3334

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-720.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -787.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 803.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001207006.3 NCBI
CUCAGUCAAGCUGAAGUGAAAACGAGACCAAGGUCUAGCUCUACUGUUG… 716 nt 0.4008
NM_021803.4 NCBI
CUCAGUCAAGCUGAAGUGAAAACGAGACCAAGGUCUAGCUCUACUGUUG… 3146 nt 0.3334
Summary

This gene encodes a member of the common-gamma chain family of cytokines with immunoregulatory activity. The encoded protein plays a role in both the innate and adaptive immune responses by inducing the differentiation, proliferation and activity of multiple target cells including macrophages, natural killer cells, B cells and cytotoxic T cells. Dysregulation of this gene plays a role in multiple immune-mediated diseases including lupus, psoriasis and chronic inflammatory diseases. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the IL21 was significantly upregulated at 60 days post-injury in microglia isolated from brains after controlled cortical impact, indicating its role in regulating immune responses during the chronic phase of traumatic brain injury [Izzy et al. DOI:10.3389/fncel.2019.00307].